Povijest pokreta baptista u Americi pomno prati glavne događaje koji su Ameriku definirali kao naciju. Na rast crkve zrcali se i utječe dolazak izvornih doseljenika, američki revolucionarni rat i građanski rat. Praćenjem podrijetla pokreta vidi se kako su nastale razlike između Južne konvencije i američkih baptista. Unatoč razlikama, još uvijek postoje mnoge sličnosti između dviju grana koje datiraju iz ranih korijena crkava.
Podrijetlo baptističkog pokreta prilično je složeno. Može se promatrati kao ona koja je narasla iz protestantskih početaka, a ne nastajala preko noći. Iako su neki učenjaci pokušali ući u trag podrijetla baptista do biblijskih dana, mnogi akademici i kritičari to popuste i vide da porijeklo pokreta počinje u Velikoj Britaniji početkom 17. stoljeća. U Engleskoj su početkom 17. stoljeća mnogi kršćani bili nezadovoljni crkvom Engleske. Dijelom je to posljedica očitog rimokatoličkog utjecaja Crkve u Engleskoj (McBeth n.d.). Odjeci od Crkve započeli su s mnogim želeći se vratiti jednostavnijim učenjima Biblije. Te su se crkve slabo zvale "separatisti".
Dvije vrste baptističke denominacije potječu od većeg tijela separatista. Oni koji su bili generalni baptisti, koji su vjerovali u opšte pomirenje nakon Kristove smrti, i partikularni baptisti, koji su vjerovali samo u određenu skupinu poznatu kao „izabrani“, bili su otkupljeni (McBeth n.d.). Baptist je počeo vježbati uranjanje krštenjem kad su cijelo tijelo i glava uronjeni u vodu (McBeth n.d.). Praksa koju danas rade baptisti i potječe od separatista koji su putovali u Holandiju i bili svjedoci nizozemskih anabaptističkih sekti koje se kršte na takav način. Izraz Baptist se, poput mnogih stvari u povijesti, koristio pogrdno. U početku su se baptisti nazivali "braćom" ili "braćom krštenim putem" (McBeth n.d.).
Rani baptisti u Americi izvorno su došli iz Engleske kako bi izbjegli vjerski progon na gotovo isti način kao što su to učinili drugi separatisti. Rodger Williams i John Clarke mogu se promatrati kao prvi baptistički ministri koji su stigli u Ameriku (Baker n.d.). Oni su osnovali prvu baptističku crkvu u Providenceu, nazvanu, prije originalno, Prvu baptističku crkvu u Americi 1638. godine. Crkva u svojim ranim godinama i baptistički pokret u cjelini nisu doživjeli ogroman rast u pogledu vjernika. Do 1740. u Americi je bilo otprilike samo 300 do 400 članova (Baker n.d.).
Međutim, 1755. godine dogodio se veliki preporod. Razlog su tome bila dvojica ljudi, naročito Shubal Steams i Daniel Marshal, koji su započeli zdušno propovijedati u južnim kolonijama i na zapadnoj granici. Ovo je oživljavanje pružilo obrasce za crkveni život koji južni baptisti i danas slijede (Baker n.d.). Zbog protivljenja baptista javnim porezima koji su podržavali određene crkve, naime, Crkve u Engleskoj i njihove doktrine o neovisnosti od uplitanja države; mnogi su postali aktivni domoljubi u američkom revolucionarnom ratu 1775. godine, zarađujući obožavanje nekih od utemeljitelja, poput Georgea Washingtona (Baker n.d.).
Od 1707. do 1814. formirane su razne baptističke organizacije koje su pomagale u jačanju crkve, formiranju misionara i pojašnjavanju nauka. Tek do formiranja Opće misionarske konvencije 1814. godine od ostalih udruga formirano je uistinu reprezentativno tijelo za čitavu Ameriku. Gotovo od početka razlike u mišljenjima porasle su između sjevera i juga. Južni baptisti su željeli da organizacija bude udružena, što znači da postoji jedno denominacijsko tijelo koje nadgleda sve aspekte crkve, a ne oblik društva koji za svako poslanje ima odvojeno društvo (Baker n.d.). Kao što ćemo vidjeti u nastavku, takva različita mišljenja i povijesni događaji koji bi se odvijali duboko bi utjecali na Opću misijsku konvenciju u državnim okvirima.
Kao što je već spomenuto, Opća misionarska konvencija dovela je do izražaja stare kolonijalne razlike. Bilo da se radi o zapadnom seljaku, gospodarstvu sa sjevera ili o plantaži na jugu, svatko je imao različito mišljenje o tome kako najbolje služiti baptističkoj vjeri. Najveće pitanje bilo je ropstvo. Može se tvrditi da je to izravno odražavalo prevladavajuće tenzije prije i tijekom građanskog rata. Južni baptisti su počeli podržavati plemiće u onome što su smatrali njihovim pravom na posjedovanje robova i htjeli su vlasnicima robova omogućiti da budu misionari (Graham 2015). Iako je ropstvo mrlja na čovječanstvu, mnogi povjesničari baptista bili su mučni da podsjećaju čitatelje da je samo manjina baptista posjedovala robove, otprilike dvije trećine nisu posjedovale robove (Baker n.d.). Baptističke kongregacije općenito su činile niže ekonomske klase. Bez obzira na to, ostaje povijesna činjenica da su južni baptisti podržavali robovlasnike na institucionalnoj razini u provođenju onoga što su smatrali pravom, moralno odbojnim pravom, ali svejedno.
Ropstvo nije jedina razlika koja je uzrokovala razdor u gore spomenutoj konvenciji. Kao što je gore spomenuto, južni baptisti su i dalje željeli jače denominacijsko jedinstvo bez načina da ostvare tu želju izazvali su mnogo rasprava (Baker n.d.). Te su razlike na kraju prouzrokovale formiranje Konvencije o južnom baptističkom savezu 10. svibnja 1845. Konvencija o južnom baptistu i danas postoji. U stvari, to je najveća baptistička organizacija na planeti i najveća protestantska organizacija u Sjedinjenim Državama s preko 15 milijuna članova, prema nedavnom istraživanju Južne baptističke konvencije. Važno je napomenuti da organizacija više ne podržava ropstvo i nedavno se obvezala na stav o nerasizmu u svim svojim crkvama. To se može vidjeti u rezoluciji iz 1995. godine pod naslovom „Rezolucija o rasnom pomirenju povodom 150. godišnjice Konvencije Južnog baptista“ od organizacije koja je prihvatila spoznaju o svojoj povijesti i poduzela mjere za izmjenu i sprečavanje nepravde iz prošlosti (SBC 1995). Daljnje konferencije su se dogodile tamo gdje su se sukobile teške prošlosti organizacija i promovirale daljnje rasprave o rasizmu, seksualnosti i vjerskim slobodama u nastojanju da se bore protiv smanjenja broja članova, posebno među mladima (Graham 2015).
Baptisti na sjeveru postali su poznati kao američke baptističke crkve u SAD-u, a oni i dalje dijele mnoga temeljna uvjerenja s Konvencijom južnih baptista, kao i baptisti uopće. Međutim, postoje razlike, i općenito je Konvencija Južnog baptista konzervativnija u pogledu i pristupu. Slijedi popis ključnih razlika između dvaju tijela:
Ovaj popis ni na koji način nije iscrpan, a različite će crkve unutar iste organizacije imati različita mišljenja. Ono što se može vidjeti u gornjem članku je koliko je baptistička crkva usko povezana s američkom poviješću i vrijednostima koje je nekada imala i vrijednostima koje danas čuva.