Razlika između 1D i 2D gel elektroforeze

ključna razlika između 1D i 2D gel elektroforeze su svojstva koja se koriste za razdvajanje proteina na gel elektroforezi. 1D gel elektroforeza odvaja samo proteine ​​na osnovi molekulske težine dok 2D gel elektroforeza razdvaja proteine ​​na osnovu njegove izoelektrične točke i molekularne težine.

Odvajanje proteina gel elektroforezom važna je tehnika karakterizacije proteina. Proteini imaju različita svojstva; prema tome, odvajanje je složenije u odnosu na razdvajanje DNK elektroforezom gela Agarose.

SADRŽAJ

1. Pregled i ključne razlike
2. Što je 1D gel elektroforeza
3. Što je 2D gel elektroforeza
4. Sličnosti između 1D i 2D gel elektroforeze
5. Usporedna usporedba - 1D vs 2D gel elektroforeza u tabelarnom obliku
6. Sažetak

Što je 1D gel elektroforeza?

1D gel elektroforeza, poznata i kao jedno dimenzionalna gel elektroforeza, metoda je odvajanja proteina koja se temelji na molekularnoj težini. Odvajanje proteina uglavnom se odvija elektroforezom poliakrilamidnog gela. Na temelju koncepta gel elektroforeze, molekule se odvajaju po svojstvu molekularne težine i naboja.

Stoga, da bi se proteinima ujednačio naboj, liječenje natrijevim dodecil sulfatom (SDS) provodi se prije gel elektroforeze. SDS denaturira proteine ​​i pruža ujednačen negativan naboj proteina; kada se dogodi primjena električnog polja, proteini prelaze na pozitivan terminal na temelju njihove molekularne težine. Tako se u razdvajanju smatra samo jedno svojstvo. Zbog toga se ova metoda naziva 1D gel elektroforeza.

Slika 01: 1D gel elektroforeza

Tijekom 1D gel elektroforeze proteini se odvajaju na temelju njihove molekularne težine. S tim u vezi, molekule manje težine migriraju brže u gelu u odnosu na proteine ​​velike molekulske mase. Tako proteini velike težine ostaju u blizini jažica.

Što je 2D gel elektroforeza?

2D gel elektroforeza ili dvodimenzionalna gel elektroforeza razdvaja proteine ​​na temelju dva svojstva. Dva su svojstva izoelektrična točka proteina i molekularna težina. Ova metoda razdvajanja proteina povećava razlučivost razdvajanja proteina. Izoelektrična točka proteina ovisi o pH pri kojem je protein neutralan.

Slika 02: 2D gel elektroforeza

Dakle, u 2D gel elektroforezi pusti se da protein djeluje na fiksni gradijent pH u prvoj dimenziji. U drugoj dimenziji, proteini se odvajaju vertikalnom ili horizontalnom poliforekrilamidnom elektroforezom. Tako se proteini odvajaju prema svojoj molekularnoj težini u drugoj dimenziji.

Uz to, ova metoda gel elektroforeze povećava razlučivost odvajanja proteina. Stoga su razdvojeni proteini čistiji. Međutim, cijena tehnike mnogo je viša od jedne dimenzijske gel elektroforeze.

Koje su sličnosti između 1D i 2D gel elektroforeze?

• Obje tehnike razdvajaju proteine.
• Dakle, oni su važni u karakterizaciji proteina.

Koja je razlika između 1D i 2D gel elektroforeze?

Ključna razlika između 1D i 2D elektroforeze gela je u tome što 1D gel elektroforeza razdvaja proteine ​​samo na molekularnoj težini, dok 2D gel elektroforeza razdvaja proteine ​​na osnovi izoelektrične točke i molekularne težine. Zbog ove osnovne razlike između 1D i 2D gel elektroforeze, razlučivost odvajanja proteina i cijene ove dvije tehnike također se razlikuju. 2D gel elektroforeza pokazuje visoku razlučivost od 1D gel elektroforeze. Međutim, 2D gel elektroforeza je skuplja od 1D gel elektroforeze.

Niže infografika sažima razliku između 1D i 2D gel elektroforeze.

Sažetak - 1D vs 2D gel elektroforeza

Razdvajanje proteina ovisi o mnogim čimbenicima. 1D gel elektroforeza odvaja proteine ​​na temelju samo molekularne težine. Međutim, dvodimenzionalna ili dvodimenzionalna elektroforeza povećava razlučivost odvajanja proteina. Nadalje, 2D gel elektroforeza odvaja proteine ​​na temelju izoelektrične točke i molekularne težine. Stoga su ovi podaci važni za daljnju obradu proteina i u području proteomike. Dakle, ovo je sažetak razlike između 1D i 2D elektroforeze gela.

Referenca:

1. Galeva, Nadezhda i MichailAltermann. „Usporedba jednodimenzionalne i dvodimenzionalne gel elektroforeze kao alata za razdvajanje proteomske analize mikrosoma jetre štakora: citokroma P450 i drugih membranskih proteina.“ Proteomics, Američka nacionalna medicinska knjižnica, lipanj 2002., dostupno ovdje.

Ljubaznošću slike:

1. "Elektroforeza - punjenje 1D gelastih jažica smjesom proteina" Jean-Etienne Poirrier - Punjenje 1D gelovskih jažica smjesom proteina (CC BY-SA 2.0) putem Commons Wikimedia
2. "2D elektroforeza" Nacionalnog instituta za zdravlje - Centar za nanobiologiju za istraživanje raka, Nacionalni institut za zdravlje (javno područje) putem Commons Wikimedia