Agaroza i poliakrilamid su vodotopljivi polimeri, ali između njih se mogu vidjeti mnoge razlike počevši od njihovog nastanka. I Agarose i Poliakrilamid imaju nešto zajedničko u svojoj sposobnosti stvaranja poroznih gel matrica. Unatoč tome, postoji niz različitih razlika između to dvoje. Glavne razlike između oba ova polimera leže u njihovoj prirodi podrijetla, kemijskoj strukturi, različitoj upotrebi i njihovoj izvedbi u smislu gel elektroforeze.
Agaroza je prirodni linearni polimer koji nastaje iz složenog polimera zvanog agar koji se nalazi u morskim algama. Agaroza se ekstrahira iz agara uklanjanjem proteinske komponente koja se naziva agaropectin. Agaroza je ono što daje agaru sposobnost da stvara gelove.
Glavna upotreba agaroze je u mikrobiološkim i molekularno-biološkim studijama. U mikrobiološkim istraživanjima, agaroza, kad je dodana odgovarajućim hranjivim tvarima, pruža čvrstu osnovu za uzgoj mikroorganizama poput bakterija i gljivica. Kada se koristi u polutvrdim koncentracijama, može biti korisno za procjenu pokretljivosti ovih mikroorganizama. U molekularnoj biologiji služi kao važan alat za jedan od najosnovnijih postupaka razlučivanja nazvan 'gel elektroforeza' ili 'elektroforeza agaroznog gela' (DOB). Gel elektroforeza je proces koji omogućava razlučivanje ili odvajanje nukleinskih kiselina ili proteina na temelju njihove veličine i naboja. Ovdje agaroza služi kao porozni gel nalik na sito kroz koji se događa razdvajanje.
Struktura agaroze
Poliakrilamid je sintetički polimer i koristi se u širokoj industriji. Kao što je ranije spomenuto, njegova upotreba oslanja se na njegovu sposobnost stvaranja gelova. Međutim, uz to, njegova sposobnost zadržavanja i odvodnje vode u različitim koncentracijama također se koristi u raznim industrijama.
Najrašireniji i uobičajena uporaba poliakrilamida je u obradi otpadnih voda. Ovdje se koristi kao sredstvo za flokulaciju za uklanjanje suspendiranog organskog materijala; na taj način poboljšava zamućenost i bistreći vodu. Druga upotreba poliakrilamida je u industriji papira. Ovdje se koristi ili za zadržavanje ili odvod vode iz papirne kaše po potrebi. Slično se u poljoprivrednoj i građevinskoj industriji koristi kao sredstvo za usporavanje tla radi sprečavanja erozije tla i poboljšanja njegove kvalitete.
Poput agaroze, i poliakrilamid se koristi u molekularnoj biologiji kao važno sredstvo razlučivanja u sličnom procesu tzv.Poliakrilamid gel elektroforeza '(STRANICA). Pored svega navedenog, poliakrilamid se također koristi u preradi rude i proizvodnji flokulacijskog agensa za uklanjanje bilo kojeg suspendiranog organskog materijala; na taj način poboljšava zamućenost i bistreći vodu. Druga upotreba poliakrilamida je u industriji papira. Ovdje se koristi ili za zadržavanje ili odvod vode iz papirne kaše po potrebi. Slično se u poljoprivrednoj i građevinskoj industriji koristi kao sredstvo za usporavanje tla radi sprečavanja erozije tla i poboljšanja njegove kvalitete. Pored svega navedenog, poliakrilamid se koristi i u proizvodnji aditiva u hrani, mekih kontaktnih leća i tekstila..
Struktura poliakrilamida
agaroze: Agaroza je polimer prirodnog podrijetla. Potječe iz morskih algi.
poliakrilamidnom: Poliakrilamid je sintetskog podrijetla i ne nalazi se ni pod kojim prirodnim okolnostima.
agaroze: Molekularna formula agaroze je C24H38O19.
poliakrilamidnom: Molekularna formula poliakrilamida je (C 3H5NE)n.
agaroze: Agaroza je linearni polisaharid. Sastoji se od ponavljajućih disaharidnih jedinica koje se nazivaju agrobioza i koje se drže zajedno vodikovim vezama.
poliakrilamidnom: Poliakrilamid je kemijski umreženi polimer. Sastoji se od monomera akrilamida i umrežavajućeg agensa N, N'-metilenbisakrilamida.
agaroze: I agaroza i njena monomerna agrobioza nisu netoksične prirode.
poliakrilamidnom: Monomerna jedinica poliakrilamida, akrilamida, je pretpostavljeni kancerogen i poznati neurotoksin, dok je polimerizirani oblik netoksičan po prirodi.
agaroze: Priprema agaroznog gela za AGE manje je vremena, jednostavno i jednostavno i ne zahtijeva inicijator ili polimerizacijski katalizator.
poliakrilamidnom: Priprema poliakrilamidnog gela za PAGE dugotrajna je i naporna, a također zahtijeva inicijator (amonijev persulfat) i polimerizacijski katalizator (N, N, N ', N'-tetrametiletilendiamin - TEMED).
Poliakrilamidni gelovi kemijski su stabilniji od agaroznih gelova.
S obzirom na istu koncentraciju, matrice poliakrilamidnog gela imaju manje veličine pora u usporedbi s matricom agaroznog gela.
Veličina pora poliakrilamidnih gelova može se mijenjati na kontroliraniji način od one agarozne gelove.
Poliakrilamidni gelovi imaju visoku razlučivost, dok agarozni gelovi imaju malu razlučivost.
Poliakrilamidni gelovi mogu primiti veće količine nukleinske kiseline od agaroznih gelova za rezoluciju.
Ljubaznošću slika: Agaroza i struktura poliakrilamida putem Wikicommonsa (Public Domain)