Razlika između Alpha Helix-a i Beta plisiranog lista

Ključna razlika - Alpha Helix vs Beta na ploči
 

Alpha helices i beta nabrane ploče dvije su najčešće pronađene sekundarne strukture u polipeptidnom lancu. Ove dvije strukturne komponente prvi su glavni koraci u procesu savijanja polipeptidnog lanca. ključna razlika između Alpha Helix i Beta Pleated Sheet nalazi se u njihovom struktura; imaju dva različita oblika za obavljanje određenog posla.

Što je Alpha Helix?

Alfa helix je desna zavojnica aminokiselinskih ostataka na polipeptidnom lancu. Raspon aminokiselinskih ostataka može varirati od 4 do 40 ostataka. Vodikove veze formirane između kisika C = O grupe na gornjoj zavojnici i vodika N-H skupine donje zavojnice pomažu da se zavojnica drži zajedno. Svaka četiri aminokiselinska ostatka u lancu na gornji način nastaje vodikova veza. Ovaj jednolični uzorak daje određene značajke, poput debljine zavojnice, i diktira duljinu svakog kompletnog zavoja duž osi spirala. Stabilnost alfa-spiralne strukture ovisi o nekoliko čimbenika.

O atomi u crvenoj boji, N atomi u plavoj, a vodikove veze kao zelene isprekidane crte

Što je beta betonirana lista?

Beta nabrane ploče, poznate i kao beta lista, smatra se drugim oblikom sekundarne strukture proteina. Sadrži beta žljebove koji su bočno povezani najmanje dvije ili tri okosnice vodikovih veza kako bi tvorili upleteni, nabrani list kao što je prikazano na slici. Beta lana je protezanje polipeptidnog lanca; njegova duljina općenito je jednaka 3 do 10 aminokiselina, uključujući kralježnicu u proširenom potvrđivanju.

4-lančani antiparalni β fragment lista iz kristalne strukture enzima katalaze.
a) prikazivanje antiparalnih vodikovih veza (točkastih) između peptidnih NH i CO skupina na susjednim lancima. Strelice označavaju smjer lanca, a konture gustoće elektrona ocrtavaju ne-H atome. O atomi su crvene kuglice, N atomi su plavi, a H atomi izostavljeni radi jednostavnosti; bočne lance prikazane su samo prema prvom atomu C bočne lance (zelena)
b) Pogled na ivice središnje dvije β niti

U beta pločastim listovima polipeptidni lanci teku jedan pored drugog. Ime je dobilo popločan lim zbog valovitog izgleda građevine. Povezani su zajedno vodikovim vezama. Ova struktura omogućava stvaranje više vodikovih veza istezanjem polipeptidnog lanca.

Koja je razlika između Alpha Helix-a i Beta Pleated Sheet-a?

Struktura Alpha Helix i Beta plisated folija

Alpha Helix:

U ovoj je strukturi polipeptidna okosnica čvrsto vezana oko zamišljene osi kao spiralna struktura. Poznat je i kao helikoidni raspored peptidnog lanca.

Stvaranje alfa-helix strukture događa se kada su polipeptidni lanci uvijeni u spiralu. To omogućava svim aminokiselinama u lancu da međusobno tvore vodikove veze (veza između molekule kisika i molekule vodika). Vodikove veze omogućuju da spirala drži spiralni oblik i daje tijesnu zavojnicu. Ovaj spiralni oblik čini alfa helix vrlo jakim.

Vodikove veze označene su žutim točkama.

Beta nagurani list:

Kada se dva ili više fragmenata polipeptidnih lanaca međusobno preklapaju, tvoreći niz vodikovih veza međusobno, mogu se pronaći sljedeće strukture. Može se dogoditi na dva načina; paralelni raspored i anti-paralelni raspored.

Primjeri strukture:

Alpha Helix: Nokti ili nokti na noktima mogu se uzeti kao primjer alfa strukture vijaka.

Beta nagurani list: Struktura perja slična je strukturi beta pločastih listova.

Značajke strukture:

Alpha Helix: U strukturi alfa spirale postoji 3,6 aminokiselina po okretaju spirale. Sve peptidne veze su trans i planarne, a N-H skupine peptidnih veza usmjerene su u istom smjeru, što je otprilike paralelno s osi spirale. C = O skupine svih peptidnih veza usmjerene su u suprotnom smjeru i paralelne su s osi spirale. C = O grupa svake peptidne veze vezana je za N-H skupinu peptidne veze tvoreći vodikovu vezu. Sve R-skupine usmjerene su prema dolje iz spirale.

Beta nagurani list: Svaka peptidna veza na ploči s beta pločicama je ravna i ima transkonformaciju. C = O i N-H skupine peptidnih veza iz susjednih lanaca nalaze se u istoj ravnini i usmjerene jedna prema drugoj tvoreći vodikovu vezu između njih. Sve R- skupine u bilo kojem lancu mogu se alternativno pojaviti iznad i ispod ravnine lista.

definicije:

Sekundarna struktura: Oblik je sklopivog proteina zbog vezanja vodika između njegovih amidnih i karbonilnih grupa u kralježnici.

Reference: "Struktura proteina". ChemWiki: Hipertekst dinamičke kemije „Sekundarna struktura proteina: α-helice i β-listovi“. Proteinstructures.com Salam Al Karadaghi "Organska kemija". Virtualni udžbenik o ćeliji "Beta Sheet". Wikipedia Ljubaznošću: "Mioglobin elektronike gustoće elektrona 2nrl 17-32" Autor Dcrjsr - Vlastiti rad (CC BY 3.0) putem Commons Wikimedia "Proteinska sekundarna struktura", autor: Korisnik: Bikadi (CC BY -SA 3.0) putem Commons Wikimedia „1gwe antipar beta Sheet oboje“ od Dcrjsr - Vlastiti rad (CC BY 3.0) putem Commons Wikimedia