Razlika između naprijed i obrnutog temeljnog premaza

Ključna razlika - naprijed vs Reverse Primer
 

Lančana reakcija polimeraze (PCR) metoda je amplifikacije DNA koja se koristi u Molekularno biološkoj primjeni. To je uobičajena tehnika koja stvara milijune do milijarde primjeraka posebno zainteresiranog slijeda DNK. To je in vitro metoda koja se izvodi u laboratorijima. PCR tehnika potpuno ovisi o komercijalno proizvedenoj DNA polimerazi zvanoj Taq polimeraza. A također zahtijeva nekoliko drugih komponenti i pravilno održavanje temperature. Jedna važna komponenta su temeljni premazi. Primeri su kratke sekvence DNA posebno dizajnirane za ciljni slijed DNK. Obično su duljine oko 20 nukleotida. Taq polimeraza katalizira dodavanje nukleotida u postojeći nukleotidni niz. Stoga se temeljni premazi služe kao polazna točka sinteze novih niti. Taq polimeraza djeluje samo u smjeru 5 'do 3', stoga se sinteza DNA odvija u istom 5 'do 3' smjeru. Budući da je DNK dvolančana, potrebne su dvije vrste primera u PCR-u. Poznati su kao naprijed i obrnuti temeljni premaz. Prednji i reverzni temeljni premazi nazivaju se na temelju smjera izduženja primera u DNA kada se dogodi sinteza DNA. Napredni prajmer se angelira antisense DNA lancem i započinje sintezu + vend lana gena u smjeru 5 'do 3'. Reverzni temeljni premaz odzračuje osjetilnom niti i započinje sintezu komplementarnog niza kodirajućeg lanca; koji je -ve lanac gena u 5'to 3 'smjeru. Ovo je ključna razlika između naprijed i natrag primera.

SADRŽAJ

1. Pregled i ključne razlike
2. Što je Forward Primer
3. Što je obrnuti primer
4. Sličnosti između naprijed i obrnutog temeljnog premaza
5. Usporedba - Usporedba prema naprijed prema nazad u tabelarnom obliku
6. Sažetak

Što je Forward Primer?

Orijentacija prema naprijed je sinteza kodirajućeg lanca ili niti smisla gena. Taq polimeraza katalizira sintezu novog niti u smjeru 5 'do 3'. Sinteza kodirajućeg niza nastaje kada se temeljni premaz isprazni nekodiranim ili antisenskim niti i produži u smjeru 5 'do 3'.

Slika 01: Naprijed i natrag temeljni premazi

Primer koji se isijava s antisense trakom ili nekodirajućim niti ili slojem predloška poznat je kao prednji primer jer prednji prajmer djeluje kao polazna točka za sintezu kodirajućeg ili pozitivnog lanca gena. Napredni temeljni premaz ima kratku nukleotidnu sekvencu koja je komplementarna 3 'bočnom kraju antisense lanca. Hibridizira se s antisenskom strukom i olakšava Taq polimerazom za dodavanje nukleotida koji su komplementarni lancu predloška..

Što je obrnuti primer?

Obrnuti prajmer je kratki slijed DNK koji se isijava s 3 'kraja osjetilne niti ili kodirajućeg lanca. Obrnuti primer služi kao polazna točka za sintezu komplementarnog niza kodirajuće sekvence ili nekodirajuće sekvence. Obrnuti temeljni premaz dizajniran je komplementarno 3 'kraju kodirajućeg niza. Dakle, on odgađuje s prirubljivog 3 'kraja kodirajuće niti i omogućuje Taq polimerazi da sintetizira antisense nit ili predložak. Budući da je orijentacija obrnuta, ovaj temeljni premaz označen je kao obrnuti temeljni premaz.

I obrnuti i naprijed početni slojevi važni su za proizvodnju milijuna do milijardi kopija određenih regija DNA koja su ciljana ili zainteresirana.

Koje su sličnosti između naprijed i obrnutog temeljnog premaza?

• Prednji i reverzni prajmeri su napravljeni od oligonukleotida.
• I prednji i reverzni primeri posjeduju kratki nukleotidni slijed komplementarni do bočnim krajevima dvostrukih lanaca DNA.
• I Prednji i Reverzni primeri se obično sastoje od 20 nukleotida.
• I prednji i reverzni temeljni premazi koriste se u lančanim reakcijama polimeraze.
• I prednji i reverzni temeljni premazi se komercijalno sintetiziraju.
• I prednji i obrnuti početni slojevi su stabilni na temperaturu i obično imaju sličan Tm.
• Prednji i reverzni primeri se angeliraju ciljanim DNK sekvencama.
• Prednji i reverzni temeljni premazi dizajnirani su u skladu s PCR reakcijama.
• I prema naprijed i prema nazad služe kao početne točke za amplifikaciju DNA.
• I obrnuti i naprijed početni slojevi važni su za proizvodnju milijuna kopija određenih regija ciljanih ili zainteresiranih DNK sekvenci.

Koja je razlika između naprijed i obrnutog primera?

Forward Primer vs Reverse Primer
Napredni primer je kratka DNK sekvenca koja se hibridizira s 3 'krajem nekodirajućeg ili šablonskog niza gena i služi kao polazna točka za sintezu kodirajuće sekvence.	Obrnuti prajmer je kratki DNK niz koji se hibridizira s 3 'koncem kodiranja ili netemplatirani niz i služi kao polazna točka za sintezu nekodirajuće sekvence.
Žica za žarenje
Napredni temeljni premaz za ispiranje s trakom predloška.	Obrnuti temeljni premazi za očvršćivanje s nepomičnom niti.
Rezultat novog slijeda
Napredni primer olakšava sintezu kodirajuće sekvence.	Obrnuti primer olakšava sintezu nekodirajuće sekvence.

Sažetak - Naprijed vs Reverse Primer

Postoje dvije vrste primera koji su uključeni u PCR tehniku. Prednji su i obrnuti početni slojevi. Na temelju produženja primera u sintezi novih DNA lanaca, ti se prajmiri označavaju ili nazivaju. Taq polimeraza sintetizira novu DNA u 5 'do 3' orijentaciji. Stoga su temeljni premazi oblikovani kao komplementarni 3 'krajevi dvostrukih niti. Naprijed temeljni premaz koji se produžava u 5 'do 3' smjeru hibridizira s 3 'koncem antisensea ili šablonom ili nekodirajućim nizom. Ona služi kao polazna točka za sintezu kodirajuće sekvence. Obrnuti temeljni premaz koji se produžava u smjeru 5 'do 3' hibridizira se s 3 'koncem kodiranja ili netemplatom ili smislom. Ona služi kao polazna točka za sintezu nekodirajućeg niza. To je razlika između naprijed i obrnutog temeljnog premaza.

Referenca:

1. "Primer (Molekularna biologija)." Wikipedia, Zaklada Wikimedia, 20. veljače 2018. Dostupno ovdje 
2. "Lančana reakcija polimeraze (PCR)." Khan Akademija. Dostupno ovdje 

Ljubaznošću slike:

1.'Primers RevComp Melted2'Byy Richard Wheeler (Zephyris) - Vlastiti rad, (CC BY-SA 3.0) preko Commons Wikimedia