Razlika između gel elektroforeze i SDS stranice

Ključna razlika - Gel elektroforeza prema SDS stranici
 

Gelna elektroforeza je tehnika koja odvaja makromolekule u električnom polju. Uobičajena je metoda u molekularnoj biologiji za odvajanje DNK, RNA i proteina iz smjesa u skladu s njihovim molekularnim veličinama. SDS Page je vrsta gel elektroforeze koja se koristi za odvajanje proteina od proteinske mješavine na temelju njihovih veličina. Gel elektroforeza je pojam koji se koristi za označavanje uobičajene tehnike koja se primjenjuje za odvajanje DNK, RNA i proteina dok SDS Page je jedna vrsta gel elektroforeze. Ovo je ključna razlika između gel elektroforeze i SDS Page.

SADRŽAJ
1. Pregled i ključne razlike
2. Što je elektroforeza gela
3. Što je stranica SDS
4. Usporedna usporedba - Gel elektroforeza vs SDS stranica
5. Sažetak

Što je gel elektroforeza?

Gelna elektroforeza uobičajena je tehnika koja se koristi u laboratorijima za odvajanje nabijenih molekula poput DNK, RNA, proteina itd. Od njihovih mješavina. Gel se koristi u gel elektroforezi. Djeluje kao molekularno sito. Postoje dvije vrste gelova koji se koriste u elektroforezi gela, naime agaroza i poliakrilamid. Odabir gela i preparata gela važni su čimbenici koje treba uzeti u obzir u gel elektroforezi jer veličinu pora gela treba pažljivo manipulirati radi dobrog odvajanja molekula gel elektroforezom. Gel elektroforeza ima električno polje spojeno na dva kraja gela. Jedan kraj gela pokazuje pozitivno naelektrisanje, dok je drugi kraj negativno nabijen.

DNA i RNA su negativno nabijene molekule. Nakon što se u negativan kraj gela stave u gel i primijene na električno polje, oni prelaze kroz pore gela prema pozitivno nabijenom kraju gela. Brzina migracije ovisi o naboju i veličini molekule. Manji molekuli lako migriraju kroz pore gela u odnosu na veće molekule. Stoga, manji molekuli putuju veliku udaljenost kroz gel, a veći molekuli putuju na malu udaljenost. Za promatranje putovanja molekula na gelu koriste se posebne vrste boja. Električno polje se primjenjuje na određeno vremensko razdoblje i zaustavlja se radi sprečavanja gubitka molekula i zadržavanja molekula na njihovim prevoženim položajima. U gelu se mogu primijetiti različite trake. Ovi pojasevi predstavljaju molekule različitih veličina. Stoga je gel elektroforeza korisna za razlikovanje molekula prema njihovoj veličini.

Gel elektroforeza je uključena u različite tehnike kao preparativnu tehniku ​​u molekularnoj biologiji, kao što su PCR, RFLP, kloniranje, sekvenciranje DNK, južnjačka mrlja, mapiranje genoma itd..

Slika 01: Elektroforeza gel agaroze

Što je stranica SDS?

Elektroforeza natrijevog dodecil sulfata poliakrilamid gel (SDS Page) je vrsta gel elektroforeze koja se koristi za odvajanje proteina. Kada se gel elektroforeza koristi za odvajanje proteina, potrebni su posebni tretmani jer se proteini ne naelektriraju negativno poput DNK i RNK i ne migriraju prema pozitivnom ili negativnom kraju. Stoga se proteini denaturiraju i prevlače s negativnim nabojem prije gel-elektroforeze. To se provodi pomoću deterdženta nazvanog natrijev dodecil sulfat (SDS). Gel elektroforeza koja koristi SDS i poliakrilamidni gel za potporni medij poznata je kao SDS Page. Ova se tehnika najčešće koristi u biokemiji, genetici, forenzici i molekularnoj biologiji.

Tijekom SDS-ove stranice, proteini se miješaju sa SDS-om. SDS razvija proteine ​​u linearni oblik i premaže ih negativnim nabojem proporcionalnim njihovoj molekulskoj masi. Zbog negativnog naboja, molekule proteina migriraju prema kraju gela s pozitivnim nabojem i razdvajaju se u skladu s njihovim molekularnim masama. U SDS Page-u, poliakrilamid se koristi kao čvrsti nosač gela. Stvarno razdvajanje proteina uglavnom ovisi o svojstvima gela. Dakle, pripremu poliakrilamidnog gela treba pažljivo izvršiti i koristiti ispravne koncentracije poliakrilamida. Poliakrilamidni gelovi pokazuju veću razlučivost od gela od agaroze. Stoga se SDS Page smatra tehnikom razdvajanja proteina visoke rezolucije.

SDS Page je vrsta denaturacijske gel elektroforeze. Ima veliko ograničenje u analizi proteina. Budući da SDS denaturira proteine ​​prije odvajanja, ne dozvoljava otkrivanje enzimske aktivnosti, interakcije vezanja proteina, proteinskih kofaktora itd..

Slika 02: Stranica SDS

Koja je razlika između gel elektroforeze i SDS stranice?

Gel elektroforeza vs SDS Stranica
Gelna elektroforeza metoda je koja se izvodi za odvajanje makromolekula pomoću električnog polja.	SDS Page je tehnika elektroforeze gela visoke rezolucije koja se koristi za odvajanje proteina prema njihovoj masi.
Gel Run
Može se izvoditi vodoravno ili okomito.	Stranica SDS uvijek radi okomito.
Osnove razdvajanja
Razdvajanje se događa prema naboju i veličini.	Odvajanje proteina odvija se prema masi i naboju.
rezolucija
Elektroforeza gela od agaroze ima nisku rezoluciju, a elektroforeza gela u poliakrilamidu veću rezoluciju	Stranica SDS-a ima bolju rezoluciju.
denaturacije
Gel elektroforeza uključuje i tehnike denaturiranja i nenatrpanja.	SDS Page denaturira proteine ​​prije odvajanja.

Pregled - Gel Electrophoresis vs SDS Stranica

Gel elektroforeza uobičajena je tehnika koja se koristi za odvajanje i analizu DNK, RNA i proteina na temelju njihove veličine i naboja. Postoje dvije glavne vrste gel elektroforeze, a to je elektroforeza gela od agaroze i elektroforeza s poliakrilamidnim gelom. Gelovi od agaroze koriste se uglavnom za odvajanje nukleinskih kiselina; kada je potrebna veća razlučivost, koriste se poliakrilamidni gelovi. SDS Page je vrsta gel elektroforeze koja se obično koristi za odvajanje složenih mješavina proteina. Smatra se tehnikom odvajanja proteina visoke rezolucije. To je razlika između gel elektroforeze i SDS Page.

Reference:
1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig i David H. Petering. „Native SDS-PAGE: Elektroforetsko razdvajanje proteina visoke razlučivosti uz zadržavanje nativnih svojstava, uključujući i metalne ione. www.ncbi.nlm.nih.gov. N.p., svibanj 2014. Web. 7. travnja 2017
2. Stellwagen, Nancy C. "Elektroforeza DNA u agaroznim gelovima, poliakrilamidnim gelovima i u slobodnoj otopini." Elektroforeza. Američka nacionalna medicinska knjižnica, lipanj 2009. Web. 07. april 2017

Ljubaznošću slike:
1. "Gelelektrophoreseapparatur" (CC BY-SA 3.0) putem Commons Wikimedia
2. "Elektroforeza gela DNA agarozom" u Školi prirodnih resursa iz Ann Arbor - DNA laboratorij (CC BY 2.0) putem Commons Wikimedia