Razlika između Gene Knockout-a i Knockdown-a

ključna razlika Između gena knockout i knockdown je da je knockout gena je tehnika gdje se gen koji zanima u potpunosti uklanja (neoperativno stanje) za proučavanje funkcija gena knockdown gena je još jedna tehnika u kojoj se utišava gen koji zanima istražiti ulogu određenog gena u biološkom sustavu.

Za istraživanje funkcioniranja gena unutar živih bioloških sustava rade različite genetske tehnike. Gen nokaut i knockdown dvije su takve tehnike. Ove tehnike pomažu znanstvenicima da identificiraju funkcionalne aspekte različitih gena u živim organizmima.

SADRŽAJ

1. Pregled i ključne razlike
2. Što je Gene Knockout
3. Što je Gene Knockdown
4. Sličnosti između gena nokauta i knockdown-a
5. Usporedna usporedba - Gene Knockout vs knockdown u tabelarnom obliku
6. Sažetak

Što je Gene Knockout?

Genetički izbacivanje gena je genetska tehnika koja čini jedan ili više gena neoperativnih u živim organizmima. To je također postupak isključivanja ili brisanja gena organizma. Primarna primjena ove tehnike je proučavanje funkcije gena. Procesom se procjenjuje učinak izgubljenog ili uklonjenog gena. Proces nokautiranja također uključuje određene enzime i tehnike spajanja.

Slika 01: Gene Knockout

Nekoliko je varijacija u tehnici izbacivanja gena na temelju broja uključenih gena. Oni su dvostruki nokaut (knockout od dva gena), trostruki nokaut (knockout od tri gena) i četverostruki nokaut (knockout od četiri gena). Gen nokautom se dalje klasificira u dvije skupine; heterozigotni knockouts i homozigotni knockouts.

Što je Gene Knockdown?

Obustava gena je eksperimentalni postupak gdje taj postupak suzbija ili smanjuje ekspresiju određenog gena ili gena u organizmu. Gene ušutkava je uobičajena definicija obustave gena. Tijekom ovog postupka, aktiviranje ili degradacija proizvedene mRNA uključuje RNA interferenciju (RNAi), malu interferirajuću RNA (siRNA) i RNA kratke dlake (shRNA).

Slika 02: Gene Silencing

Primarna upotreba gena za obustavu gena je istražiti ulogu određenog gena u biološkom sustavu. Stoga ova tehnika provodi proučavanje onkogena (Bcl-2 i P53) i gena koji uzrokuju neurološke bolesti, virusne infekcije i nasljedne bolesti.

Koje su sličnosti između Gene Knockout-a i Knockdown-a?

• I genetička obrana i knockdown gena su genetske tehnike.
• Ove dvije tehnike mogu spriječiti ekspresiju gena.
• Primarna primjena obje tehnike je istražiti funkciju gena koji nas zanima.
• Oboje su sposobni identificirati različita stanja bolesti (genetska).
• Oboje bi se mogli koristiti za jedan ili više gena od interesa.

Koja je razlika između gena nokauta i knockdown-a?

Gene Knockout vs Knockdown
Gene knockout je djelovanje gena (uklanjanje gena iz DNK) organizma različitim genetskim tehnikama.	Gene knockdown je eksperimentalni postupak suzbijanja (smanjivanja ili ušutkivanja) ekspresije određenog gena ili gena organizma.
Funkcija
Olakšava proučavanje funkcija gena analizom rezultata izgubljenog gena.	Olakšava proučavanje onkogena, gena koji uzrokuju neurološke bolesti, virusne infekcije i nasljedne bolesti.
Uključivanje RNA agenata
Uključenost RNA agenata u ovu tehniku ​​je beznačajna.	U postupak su uključena sredstva kao što su siRNA, shRNA i RNAi da deaktiviraju mRNA.
Upotreba kemijskih sredstava
Koriste se enzimski agensi.	Ne koriste se takva kemijska sredstva.
Učinak na gen
Potpuno uklanja gen iz DNK-a.	Suzbiti ili ušutkati gen.
Klasifikacija
Dvostruki knockout, trostruki knockout i četverostruki knockout i heterozigotni i homozigotni knockout različite su vrste gena knockout.	Ne postoje takvi klasifikacijski sustavi za prigušivanje gena.

Pregled - Gene Knockout i Gene Knockdown

Dvije tehnike koje smo ovdje raspravljali; genski knockout i knockdown su metode za ispitivanje funkcija različitih gena. Napad gena u potpunosti čini gen neradnim, dok obaranje gena utišava gen koji zanima. Međutim, oba postupka sprečavaju ekspresiju gena. Različita sredstva su sposobna da izvrše ova dva procesa. Izbacivanje gena je vrsta brisanja dok je knockdown gena vrsta inaktivacije. Ovo je razlika između gena za knockdown.

Referenca:

1.Shaffer, Catherine. "Gene Knockout nasuprot knockdownu." News-Medical.net, 12. veljače 2018. Dostupno ovdje  
2. "Gene Knockout." Nature News, izdavačka skupina Nature. Dostupno ovdje

Ljubaznošću slike:

1.'Kokativni miševi5006-300'By Maggie Bartlett, NHGRI. (Javna domena) putem Commons Wikimedia 
2.'RNAi-pojednostavljeno'By Matzke MA, Matzke AJM (2004) Sadnja sjemena nove paradigme. PLoS Biol 2 (5): e133 doi: 10.1371 / journal.pbio.0020133., (CC BY 2.5) via Commons Wikimedia