Razlika između izolacije genomske DNK i plazmidne DNA

ključna razlika Između genomske DNK i plazmidne izolacije DNA je da izolacija genomske DNA cilja ekstrakciju genomske DNK dok izolacija plazmidne DNA cilja ekstrakciju plazmidne DNA bakterija.

Izolacija DNK je kemijski postupak koji se koristio za izoliranje DNK od različitih vrsta ili iz različitih uzoraka. Izolacija DNA važna je u tehnikama molekularne biologije nizvodno, poput gel elektroforeze, lančane reakcije polimeraze i tehnika sekvenciranja DNA. Stoga je izolacija DNA ključan kemijski proces u molekularno-biološkim studijama. Na temelju svrhe istraživanja ponekad je potrebno izolirati genomsku DNK. Pored toga, neka se istraživanja usredotočuju na izoliranje plazmidne DNA iz bakterija. Izolacija genomske DNA je proces izolacije genomske DNK iz prokariotskog ili eukariotskog uzorka. Koraci izolacije razlikuju se ovisno o vrsti stanice u kojoj se DNA izolira. Izolacija plazmidne DNA proces je izolacije plazmidne DNA iz bakterijske stanice. U usporedbi s izolacijom genomske DNA, u izolaciji plazmidne DNA ukupni je proces složen.

SADRŽAJ

1. Pregled i ključne razlike
2. Što je izolacija genomske DNA
3. Što je izolacija plazmidne DNA
4. Sličnosti između izolacije genomske DNA i plazmidne DNA
5. Usporedna usporedba - Izolacija genomske DNK vs plazmidne DNK u tabelarnom obliku
6. Sažetak

Što je izolacija genomske DNK?

Izolacija genomske DNK proces je izlučivanja čitave genomske DNK u organizam. Ovaj postupak uključuje tri glavna događaja. To su stanična liza ili nuklearna liza, razgradnja proteina ili proteoliza i taloženje genomske DNK. Korak lize može se razlikovati ovisno o vrsti stanice. Kod prokariota, budući da postoji stanična stijenka peptidoglikana, prvi korak bi trebao biti propadanje stanične stijenke. S druge strane, u eukariota, korak lize uključuje raspad plazme i nuklearne membrane kako bi se DNK izvadila u vanjštinu. Suprotno tome, posebni koraci su neophodni za liziranje biljnih i gljivičnih staničnih zidova.

Slika 01: Izolacija genomske DNA

Posljedično, nakon završetka koraka lize, na kraju će DNA doći u supernatant. Istovremeno, u otopini se događa i razgradnja proteina zbog dodavanja proteinaze K. Sljedeći korak je odvajanje genomske DNK i razgrađenih proteina jedan od drugog. Dakle, razgrađeni proteini se odvajaju taloženjem što omogućuje genomskoj DNK da ostane u supernatantu. Nakon taloženja proteina, genomska DNA može se istaložiti i ponovo suspendirati u prikladnom puferu dok ne zahtijeva eksperiment.

Genomska DNK, koja je linearna DNK, sadrži svu genetsku informaciju organizma. Drugim riječima, genom je nasljedni materijal živog organizma koji je odgovoran za sve strukturne i funkcionalne aktivnosti stanice. Sastoji se od kodirajućih i nekodirajućih nizova DNK. Kada se izolira genomska DNK, ona uključuje čitav genom organizma.

Što je izolacija plazmidne DNA?

Plazmidna izolacija DNA poseban je i kompliciraniji postupak izolacije DNK. Plazmidi su ekstrahromosomska DNA prisutna u većini bakterijskih stanica. Oni su uspavani kružni DNK koji podupire bakterije da prežive u teškim uvjetima okoline. Plazmidna DNA sastoji se od posebnih otpornih gena koji daju dodatne prednosti bakterijama poput otpornosti na antibiotike, svojstva virulencije i toksičnih svojstava.

Slika 02: Izolacija plazmidne DNA

Izolacija plazmidne DNK također uključuje tri glavna procesa; stanična liza, proteinoliza i taloženje DNK. Iako je biokemijski mehanizam izolacije sličan onom izolacije genomske DNA, postupak je složeniji od njega. Proces lize stanica najvažniji je postupak u ovom postupku. Najvažnije je da se genomska i plazmidna DNA ne smiju miješati jedna s drugom. Stoga se u postupak izolacije plazmidne DNA puno blaži postupak lize uključuje. Stoga se u većini postupaka za izolaciju plazmidne DNA koristi deterdžent; natrijev dodecil sulfat za staničnu lizu.

Koje su sličnosti između genomske DNK i izolacije plazmidne DNA?

• Izolacija genomske DNK i plazmidne DNA usredotočena je na ekstrakciju DNK iz organizma.
• Također, obje slijede isti cjelokupni postupak koji uključuje lizu stanica, razgradnju proteina i taloženje DNK.
• Nadalje, rezultirajući DNK oba procesa važan je za procese nizvodno.
• Nadalje, oba postupka izolacije uključuju korake za pročišćavanje i pohranu DNK u određenim uvjetima skladištenja.
• Pored toga, proteinaza K se koristi u obje metode za razgradnju proteina.

Koja je razlika između izolacije genomske DNA i plazmidne DNA?

Izolacija genomske DNA usmjerena je na izdvajanje čitave genomske DNK ciljnog organizma, dok se izolacija plazmidne DNA fokusira na izoliranje samo plazmidne DNA iz određene bakterijske vrste. Stoga je ovo ključna razlika između genomske DNA i izolacije plazmidne DNA. Nadalje, još jedna razlika između izolacije genomske DNA i plazmidne DNA je u postupku. Izolacija genomske DNA manje je složen postupak u usporedbi s izolacijom plazmidne DNA. Stoga je potrebno izolirati plazmidnu DNA kako bi se spriječilo miješanje genomske i plazmidne DNA..

Niže infograohic daje dodatne detalje o razlici između izolacije genomske DNK i izolacije plazmidne DNA.

Sažetak - Izolacija genomske DNK i plazmidne DNA

Izolacija DNA važan je proces u tehnikama molekularne biologije. Postoje dvije vrste DNK, naime genomska DNK i plazmidna DNA (ekstrahromosomska DNK). Na temelju zahtjeva, neki postupci provedeni su za izoliranje genomske DNA, dok se neki postupci usredotočuju na izoliranje samo plazmidne DNA iz bakterija. Stoga se koraci u oba procesa malo razlikuju jedan od drugog. Međutim, sveukupni postupak je isti u obje izolacije. Izolirana DNA oba procesa ima ogromnu primjenu u nizvodnim procesima kao što su kloniranje, gel elektroforeza i lančane reakcije polimeraze. Na kraju protokola izolacije genomske DNA, može se izolirati cjelokupna genska DNK organizma kao konačni produkt, dok se na kraju protokola izolacije plazmidne DNK plazmidna DNA odgovarajuće bakterije može izolirati kao konačni produkt. Stoga je ovo razlika između genomske DNA i izolacije plazmidne DNA.

Referenca:

1. "IZLUČIVANJE DNK IZ BAKTERIJE." DNK ekstrakcija iz bakterija. Dostupno ovdje 

Ljubaznošću slike:

1. "DNK ekstrakcija" Joo Nath - Vlastito djelo, (CC BY-SA 4.0) putem Commons Wikimedia 
2. "Mini plazma plazmida" Retama - Vlastiti rad, (CC BY-SA 4.0) preko Commons Wikimedia