ključna razlika između vektora umetanja i zamjene je da vektor za umetanje ima sposobnost umetanja umjerenih duljina strane DNK, dok zamjenski vektor ima mogućnost smještaja većih duljina strane DNK.
Fagi vektori su bakteriofagi koji se koriste za kloniranje. Postoje dvije vrste faga vektora; oni su vektor umetanja i zamjenski vektor. Također, svi vektori faga sastoje se od nebitnih gena. Međutim, ti se geni moraju ukloniti iz faga kako bi se olakšali novi strani DNK umetci.
1. Pregled i ključne razlike
2. Što su umetanji vektori
3. Što su zamjenski vektori
4. Sličnosti između umetanja i zamjenskih vektora
5. Usporedba - Usporedni vektori i Zamjenski vektori u tabelarnom obliku
6. Sažetak
Prije svega, vektor za umetanje je najjednostavniji oblik vektora za kloniranje lambde. U stvari, to je vrsta fagnog vektora koji ima jedinstveno restrikcijsko mjesto uvedeno unutar vektorskog genoma na poziciji fakultativne DNA. Nadalje, DNA faga ostaje bez uklanjanja. Ovo ne-uklanjanje fagovne DNK smanjuje veličinu umetka (strane DNK) koju treba klonirati unutar vektora. Nadalje, ovi vektori su korisni u kloniranju i ekspresiji cDNA. GT10, GT11 i Zap su primjeri ovog vektora.
Slika 01: Lambda fag
Vektor umetanja sastoji se od jednog mjesta za prepoznavanje. Primarna funkcija ovog vektora je razviti cDNA biblioteke izvedene iz eukariotskih sekvenci mRNA. Štoviše, on može smjestiti samo duljine strane DNK u rasponu između 05-11 kb. Također posjeduje jedinstveno mjesto cijepanja za ubacivanje strane DNK.
Zamjenski vektor ili supstitucijski vektor je tip vektora faga razvijen nakon uklanjanja srednjeg područja 'fragmenta punila' fagne DNA. Željeni inostrani umetak DNA zamjenjuje fagnu DNA.
Slika 02: Zamjenski vektor
Zamjenski vektori važni su u stvaranju genskih biblioteka poput EMBL4 i Charon40. Ti vektori mogu primiti veću duljinu strane DNK u rasponu od 08-24kb. Područje punila također se sastoji od gena koji faktorski vektor čini ne-održivim unutar bakterijskog domaćina.
Umetanje vs zamjenski vektori | |
Umetni vektor je vrsta vektora faga koja ima mjesto restrikcije uvedeno unutar genoma faga na mjestu fakultativne DNA. | Zamjenski vektor je vrsta fagnog vektora razvijena uklanjanjem srednjeg područja "fragmenta punila" fagne DNA. |
Veličina uloženih fragmenata | |
05-11 kb duljina | 08-24 kb duljina |
Fragment punila | |
Nema fragmenta punila | Ulomak punila zamjenjuje se stranim umetkom |
Funkcija | |
Važno za stvaranje cDNA knjižnica | Važno u stvaranju biblioteka genoma |
Primjeri | |
GT10, GT11 i Zap su primjeri | EMBL4 i Charon40 su primjeri |
Mjesto rascjepa | |
Postoji jedinstveno mjesto cijepanja | Mjesto cijepanja sadrži gene koji nisu bitni za lički ciklus |
Umetanje i zamjena vektori su dvije vrste fagnih vektora. Oba vektora imaju mjesta restrikcija koja olakšavaju smještaj novih stranih DNK umetanja. Umetnički vektori važni su u stvaranju cDNA knjižnica, dok su zamjenski vektori važni u stvaranju genskih knjižnica. Nadalje, vektori za umetanje sadrže uloške DNA s umjerenom duljinom. Ali zamjenski vektori mogu ugostiti veće duljine stranih uložaka DNK. Općenito, to je ključna razlika između umetanja i zamjenskih vektora.
1. užurbano, P i sur. "Učinkovitost umetanja prema ciljanom vektoru zamjene ovisi o različitim kromosomskim lokusima." Molekularna i stanična biologija, Američka nacionalna medicinska knjižnica, prosinac 1994., dostupno ovdje.
2. "Lambda ubacivači". Bilješke o predavanjima iz Biologije 335 - Lambda vektori, dostupni ovdje.
3. "Zamjenski vektor." Zamjenski vektor - Terminologija molekularne biologije za zamjenski vektor - GenScript, dostupna ovdje.
1. "Lambda phage" autorice Lizanne Koch - vlastiti rad s ChemBioDraw (Public Domain) putem Commons Wikimedia