Razlika između metabolomike i metabonomije

Ključna razlika - Metabolomics vs Metabonomics
 

Metaboliti su male molekule uključene u metaboličke reakcije u stanicama. Metaboliti uključuju metaboličke intermedijare, hormone, sekundarne metabolite, signalne molekule, itd. Oni su funkcionalne molekule biokemijskih reakcija stanica. Potpuni skup metabolita biološkog uzorka ili jednog organizma poznat je pod nazivom metabolomi. Metabolome je dinamična kolekcija koja se mijenja svake sekunde u tijelu. Metabolomika i metabonomija dva su termina koja se odnose na proučavanje metaboloma organizma. Ključna razlika između metabolomike i metabonomije je u tome metabolomija je više zabrinuta za normalan endogeni metabolizam i metaboličko profiliranje na staničnoj ili organskoj razini dok metabonomija se više bavi proširivanjem metaboličkog profiliranja s informacijama o poremećajima metabolizma zbog okolišnih čimbenika, bolesti, mikroorganizama u crijevima i usporedbom metaboličkog profiliranja, itd.. Metabolomiju uglavnom pokreće masena spektrometrija, a metabonomija koristi NMR spektroskopiju za analizu metabolita.

SADRŽAJ
1. Pregled i ključne razlike
2. Što je metabolomika
3. Što je metabonomija
4. Usporedna usporedba - Metabolomics vs Metabonomics
5. Sažetak

Što je metabolomija?

Metabolomika je proučavanje metaboličkih procesa koji se događaju u stanicama, biofluidima, tkivima ili organizmima. To uključuje identifikaciju i kvantifikaciju staničnih metabolita pomoću dobrih analitičkih i statističkih alata. Metabolomika se smatra važnom studijom jer otkriva podatke o metabolizmu u organizmu.

Za proučavanje supstrata i produkata metaboličkih reakcija, metabolomika koristi masenu spektrometriju kao analitičku platformu. Masena spektrometrija otkriva vrste metabolita i njihove koncentracije, odražavajući stvarno biokemijsko stanje stanica ili tkiva. Stoga se metabolomija može smatrati najboljim predstavnikom molekularnog fenotipa u organizmu. Metabolomika je omicka tehnologija malih molekula organizma u usporedbi s drugim omickim studijama; metabolomija je vrlo važna jer izravno odražava trenutni status biokemijske reakcije stanica.

Metabolomika se također može smatrati produžetkom proteomika jer nastaju zbog aktivnosti enzima koji su proteini kao što je prikazano na sljedećoj slici.

Slika 01: Shema metabolomike

Što je metabonomija?

Metabonomija se definira kao kvantitativno mjerenje multiparametrijskih metaboličkih odgovora u određeno vrijeme u odnosu na patofiziološke stresove ili genetičke modifikacije. To se obično primjenjuje na studijama o ljudskoj prehrani i reakcijama na lijekove ili bolest. Ovaj je pristup pokrenuo Jeremy Nicholson na Imperial Collegeu u Londonu i on se koristio u mnogim poljima, uključujući toksikologiju, dijagnostiku bolesti, prehranu itd. Povijesno, metabonomija je bila jedna od prvih metoda za primjenu opsega biologije sustava na studije metabolizma.

Metabonomija je više zabrinuta za usporedbu biokemijskih profila, nego za identificiranje pojedinačnih metaboličkih spojeva u metabolomiji. Stoga se metabonomija može definirati kao podskup metabolomika. Uglavnom naglašava usporedbu metaboličkih profila različitih populacija s obzirom na bolesti, stres u okolišu, genetsku modifikaciju, prehranu, lijekove itd., Jer su metaboliti dobri markeri koji signaliziraju stanje bolesti, učinke lijekova, stres u okolišu, izloženost toksinima itd.

Metabonomske studije otkrivaju i unutarćelijske i izvanćelijske metabolite. Koristi tehnike visoke propusnosti za analizu velikog broja metabolita istovremeno i opetovano, omogućujući vremensko istraživanje fiziološkog statusa stanica. Također otkriva povezanost između metabolita i patološkog statusa organizma. Za podršku metabonomskih studija mogu se upotrijebiti genomika i proteomika jer su međusobno povezani kao što je prikazano na gornjoj slici.

Koja je razlika između metabolomike i metabonomije?

 Metabolomika vs Metabonomija

Metabolomika je proučavanje kompletnog skupa metabolita u organizmu Metabonomija je kvantitativna studija multiparametrijskih metaboličkih reakcija živih sustava u vremenskoj osnovi na patofiziološke podražaje ili genetsku modifikaciju.
Glavna briga
Metabolomika se više bavi metaboličkim profiliranjem i identifikacijom pojedinih metabolita prisutnih u stanicama. Metabonomija se više bavi uspoređivanjem metabolita ili metaboličkih profila populacije u odnosu na genetske modifikacije, bolesti, stres u okolišu, patološke podražaje, lijekove itd..
Informacija
Metabolomika je uglavnom usmjerena na endogeni metabolizam. Metabonomija nije ograničena na endogeni metabolizam. Proteže se pronalaženje informacija o poremećajima metabolizma uzrokovanim unutarnjim i vanjskim čimbenicima, poput prehrambenih obrazaca, toksina, procesa bolesti itd..
Analitički alati
Kao glavna analitička platforma koristi se masnom spektrometrijom Metabonomics koristi NMR spektroskopiju kao glavnu analitičku platformu.

Rezime - Metabolomics vs Metabonomics

Metabolome predstavlja kompletan skup malih molekula koje se nazivaju metaboliti prisutni u stanici ili organizmu. Metabolomika je proučavanje cijelog metaboloma kako bi se dobio metabolički profil. Metabolomika omogućava znanstvenicima da izmjere stvarni fiziološki status stanice ili organizma. Metabonomija je dio metabolomike koji se proteže da bi izvukao informacije o multiparametrijskim metaboličkim reakcijama živih sustava na patofiziološke podražaje i genetske modifikacije. Metabonomija se ne bavi samo pojedinačnim metaboličkim profiliranjem poput metabolomika; uspoređuje metaboličke profile u odnosu na druge čimbenike kao što su stresi u okolišu, bolesti, toksini itd. I metabolomika i metabonomija uključuju ispitivanja metabolita organizama u svrhu mjerenja stvarnog fiziološkog statusa stanica. Stoga se ponekad ova dvojica smatraju sinonimima, ne uzimajući u obzir razliku između metabolomike i metabonomije.

Referenca:
1. Roessner, Ute i Jairus Bowne. "Što je zapravo metabolomija." BioTechniques - O čemu se zapravo radi u metabolomiji? N.p., travanj 2009. Web. 24. travnja 2017
2. Jeremy J. Ramsden (1). "Metabolomika i metabonomija." Springer. Springer London, 01. siječnja 1970. Web. 25. travnja 2017

Ljubaznošću slike:
1. „Metabolomska shema“ Lmaps (razgovor) - Vlastiti rad (CC BY-SA 3.0) preko Commons Wikimedia