Razlika između motiva i domene

ključna razlika između motiva i domene je da je motiv nije neovisno stabilan dok je domena neovisno stabilna.

Proteini su važne biološke makromolekule prisutne u našem tijelu. S druge strane, genetski kod gena odlučit će aminokiselinski slijed proteina. Štoviše, proteini imaju primarnu, sekundarnu i tercijarnu strukturu. Primarna struktura je aminokiselinski slijed polipeptidnog lanca. Kad se polipeptidni lanci savijaju jedan s drugim, on tvori sekundarnu strukturu proteina. Alfa helikopteri, beta listovi i super-sekundarne strukture pripadaju sekundarnim strukturama. Određene skupine super-sekundarnih elemenata poznate su kao proteinski motivi. Tercijarna struktura proteina odnosi se na njegovu trodimenzionalnu strukturu koja odlučuje o funkciji proteina. Domena je presavijeni dio molekule proteina, koja je globularna i ima diskretnu funkciju. To je temeljna funkcionalna i trodimenzionalna struktura proteina.

SADRŽAJ

1. Pregled i ključne razlike
2. Što je motiv
3. Što je Domena
4. Sličnosti između motiva i domene
5. Usporedna usporedba - motiv vs domena u tabelarnom obliku
6. Sažetak

Što je motiv?

Motiv je određena skupina super-sekundarnih elemenata proteina poput alfa helika i beta struktura. Oni su neka vrsta obrazaca prisutnih u različitim proteinima. Motivi opisuju obrasce savijanja sekundarnih strukturnih elemenata i njihove interakcije. Ovi se preklopni obrasci stabiliziraju sličnim vezama koje su prisutne u tercijarnim strukturama. Međutim, oni nisu toliko složeni kao tercijarne strukture.

Slika 01: Motiv

Jednostavne su kombinacije sekundarnih struktura proteina. Motiv nije stabilan sam po sebi. Nadalje, motivi objašnjavaju strukturu proteina, ali ne predviđaju funkciju proteina. Primjeri proteinskih motiva su beta-alfa-beta motiv, grčki motiv ključa, Beta bačva, motiv Beta-meandera, itd..

Što je Domena?

Domena je temeljna, funkcionalna i trodimenzionalna jedinica proteina. Obavlja određenu funkciju. Pojedini protein može imati nekoliko različitih domena. Svaka domena je neovisna cjelina. To je globularna struktura. Odgovorna je za određenu funkciju ili interakciju. Domene se mogu koristiti za hipoteziranje funkcije nekarakterizovanog proteina. Kada analizirate protein, važno je uzeti u obzir budući da su domene funkcionalne jedinice proteina.

Slika 02: Tri različite domene piruvat kinaze

Domene su vrlo stabilne i kompaktne strukture. Mogu se lako razlikovati od ostalih regija. Piruvatkinaza ima tri različite domene kao što je prikazano na slici 02. Duljina domene može varirati, a prosječna dužina je 100 aminokiselina. Svaka domena sadrži hidrofobnu jezgru izgrađenu od sekundarnih strukturnih jedinica. Nekoliko domena zajedno čine tercijarnu strukturu proteina.

Koje su sličnosti između motiva i domene?

• Motiv i domena jedinice su prisutne u samim molekulama proteina.
• Korisni su pri razvrstavanju proteinskih obitelji.

Koja je razlika između motiva i domene?

Motiv je određena skupina super-sekundarnih elemenata proteina poput alfa helika i beta struktura dok je domena funkcionalna cjelina proteina. Nadalje, motiv je sekundarna struktura dok je domena odgovorna za tercijarnu strukturu proteina. Štoviše, domena je neovisna cjelina, za razliku od motiva. Također, domena prikazuje funkciju proteina dok motiv nije. Ovo su glavne razlike između motiva i domene. Podaci u nastavku prikazuju razliku između motiva i domene u tabelarnom obliku.

Sažetak - Motiv prema domeni

Motiv je raspored sekundarnih struktura molekule proteina. Obično nije stabilan sam po sebi, za razliku od domene. Domena je neovisno stabilna struktura proteina. Prema tome, to može biti dio ili cijela molekula proteina. To je trodimenzionalna temeljna funkcionalna jedinica proteina. Štoviše, ima funkciju i to je neovisna cjelina. Motiv može biti dio domene. No, domena ne može biti dio motiva. To je razlika između motiva i domene.

Referenca:

1. "Proteinska domena." Wikipedia, Zaklada Wikimedia, 31. srpnja 2018. Dostupno ovdje

Ljubaznošću slike:

1. „Ključni motiv proteina toksina antraksa“ NatelewisDerivativni rad (CC BY-SA 3.0) putem Commons Wikimedia
2. "Piruvat kinazne proteinske domene" Thomas Splettstoesser - Vlastito djelo, (CC BY-SA 3.0) putem Commons Wikimedia