DNA polimeraze su široko korišteni enzimi u tehnikama molekularne biologije i prirodno su prisutni u svim organizmima koji podliježu replikaciji DNA. Oni su ključni polimerizacijski enzimi koji se uključuju tijekom replikacije. DNA polimeraza je sposobna dodati nukleotide na slobodni 3 'kraj lanca DNK, uzrokujući proširenje novog lanca. Trenutno, zbog razvoja molekularne biologije u dijagnostici bolesti i industrijskoj primjeni, važno je proizvesti polimeraze s raznim korisnim svojstvima. To povećava točnost metode i čini je bržom tehnikom. Phusion i Taq polimeraza dva su komercijalno proizvedena termostabilna enzima polimeraze koja se koriste u posebnim molekularnim primjenama. Fusion je DNA polimeraza izolirana iz Pyrococcus furiosus a koristi se uglavnom u eksperimentima s kloniranjem kako bi se povećala vjernost. Taq DNA polimeraza je standardna DNA polimeraza koja se koristi u lančanoj reakciji polimeraze (PCR), a izolirana je iz termostabilne bakterije; Thermus aquaticus. ključna razlika između dva enzima je izvorni mikroorganizam. Fusion se izolira iz ekstremofila, Pyrococcus furiosus dok je, Taq polimeraza izolirana iz termofila, Thermus aquaticus.
1. Pregled i ključne razlike
2. Što je fusion
3. Što je Taq polimeraza
4. Sličnosti između Phusion i Taq polimeraze
5. Usporedna usporedba - Phusion vs Taq polimeraza u tabelarnom obliku
6. Sažetak
Fusion DNA polimeraza je nova polimeraza koja se proizvodi izolacijom enzima iz Pyrococcus furiosus, koja je ekstremna arheja. Ti mikrobi borave u uvjetima ekstremno visokih temperatura, pa polimeraza čini polimerazu vrlo stabilnu toplinu. Fusion polimeraza koristi se za postizanje ekstremne vjernosti konvencionalnoj termostabilnoj polimerazi; Taq polimeraza. Fusion polimeraza je sposobna povećati duge predloške do 7,5 kb genomske DNK. Optimalni kapacitet polimerizacije Phusion polimeraze je 720 C. Phusion se također koristi u proizvodima za kloniranje za sekvenciranje, analizu ekspresije i analizu mutacije.
Fusion DNA polimeraza ima aktivnost 3 '- 5' egzonuklaze. To omogućava lektoriranje novointetiziranog niti nakon sinteze. Stoga se nukleotidne neusklađenosti lako popravljaju. Dakle, ima manju stopu pogreške. Opće prednosti Phusion polimeraze su;
Slika 01: Fusion
Glavni nedostatak Phusion polimeraze je taj da se ona inhibira u prisutnosti deoksiuridin trifosfata (dUTP). Kada se dUTP akumuliraju u reakcijskoj smjesi, to može inhibirati djelovanje Phusion polimeraze. To se spriječi tretiranjem reakcijske smjese s dUTPase prije dodavanja enzima. Trenutno se koristi dUTP otporna varijanta Phusion polimeraze poznata kao Pfu Turbo umjesto Phusion polimeraze kao lijek za ovaj problem.
Taq DNA polimeraza izum je revolucionirao polje molekularne biologije. Riješio je veliki problem u amplifikaciji DNA. Taq DNA polimeraza je toplinski stabilan enzim polimeraze izvađen i izoliran iz termofilne bakterije, Thermus aquaticus. Otkriće ovog enzima dovodi do razvoja PCR-a. Ovaj enzim omogućio je uporabu lančane reakcije polimeraze u amplifikaciji DNA umjesto uobičajenih napornih tehnika kloniranja. PCR se danas koristi u molekularnoj dijagnostici, poljoprivrednim i industrijskim oblastima s mnogo novih varijacija dodanih tehnici.
Slika 02: Taq polimeraza
Taq DNA polimeraza djeluje u optimalnom temperaturnom rasponu između 720C - 800C. Taq DNA polimeraza zahtijeva ko-faktor; magnezij za svoju funkciju. Taq polimeraza nema sposobnost korekcije 3 '- 5', prema tome, stopa pogreške Taq DNA polimeraze je visoka u usporedbi s novijim vrstama DNK polimeraza poput Phusion polimeraze itd. No, popularnost Taq DNA polimeraze ostaje isto u cijelom svijetu znanosti zbog praktičnosti i fleksibilnosti enzima.
Phusion vs Taq polimeraza | |
Fusion je DNA polimeraza izolirana iz Pyrococcus furiosus a koristi se uglavnom u eksperimentima s kloniranjem kako bi se povećala vjernost. | Taq DNA polimeraza je standardna DNA polimeraza koja se koristi u lančanoj reakciji polimeraze (PCR), a izolirana je iz termostabilne bakterije, Thermus aquaticus. |
Izvorni organizam | |
Fusion se ekstrahira iz ekstremofilnih arheja - Pyrococcus furiosus. | Ta književna djela protežu se od razdoblja kolonizacije do razdoblja dekolonizacije. |
Sposobnost čitanja dokaza | |
3 '- 5' dokazna sposobnost čitanja prisutna je u Phusionu. | 3 '- 5' dokazna sposobnost čitanja ne postoji u Taq polimerazi. |
Vjernost | |
Fusion ima visoku vjernost. | Taq polimeraza pokazuje nisku vjernost. |
Pojačanje | |
Fusion je sposoban pojačati duge fragmente DNA. | Taq polimeraza sposobna je amplificirati mnogo kraće fragmente DNA. |
dUTP Otrovanje | |
Djelovanje fuzije inhibirano je kvotama akumulacije. | Taq polimeraza ne inhibira dUPT. |
Phusion i Taq DNA polimeraza dvije su toplinski stabilne polimeraze koje se koriste u PCR tehnikama. Fusion je polimeraza izolirana iz ekstremofila, Pyrococcus furiosus dok je Taq izoliran od termostabilnih bakterija Thermus aquaticus. Otkrivanje Taq DNA polimeraze dovodi do PCR izuma. Phusion ima brojne prednosti u odnosu na Taq zbog čega je Phusion bolja opcija u proizvodnji DNK visoke vjernosti. Međutim, Taq polimeraza se i dalje koristi kao standardni enzim polimeraze u PCR-u. To je razlika između Phusion i Taq polimeraze.
1.Biolabi, Nova Engleska. "Taq DNA polimeraze." New England Biolabs: reagensi za industriju znanosti o životu. Dostupno ovdje
2. "Fusion DNA polimeraza." New England Biolabs. Dostupno ovdje
1.'GAM ilustrirao Nivin Nasri'By NivinN - Vlastiti rad, (CC BY-SA 4.0) putem Commons Wikimedia
2.'Taq'By Adenosine - Vlastiti rad, (CC BY-SA 3.0) putem Commons Wikimedia