Bakterije sadrže kromosomsku i nehromosomsku DNK. Kromosomska DNK igra važnu ulogu u rastu bakterija. Nehromosomska DNA ne kodira bitne gene za preživljavanje bakterija. Plazmid je vrsta prokariotske nehromosomske DNK. Oni su mali, kružni dvolančani DNK koji bakterijama daje dodatne genetske prednosti. Transposon je slijed DNK koji se može premjestiti na nove položaje unutar genoma. Poznati su i kao pokretni genetski materijal bakterija. Ključna razlika između plazmida i transpozona je ta plazmid je nehromosomska DNK koja se nezavisno replicira unutar bakterije dok transposon je segment kromosomske DNK koji translocira unutar genoma bakterija i mijenja genetski slijed kromosoma.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključne razlike
2. Što je plazmid
3. Što je Transposon
4. Usporedna usporedba - plazmid vs Transposon
5. Sažetak
Plazmid je ekstrahromosomska DNK prokariota. Može se replicirati neovisno od bakterijskog kromosoma. Jedna bakterija može imati nekoliko plazmida unutra. Plazmidi su zatvoreni kružni dijelovi DNK i male su veličine. Plazmidna DNA ima nekoliko gena koji nisu bitni za preživljavanje bakterija. Međutim, ti geni u plazmidima pružaju dodatne genetske prednosti bakterijama poput rezistencije na antibiotike, otpornosti na herbicide, tolerancije na teške metale itd. Posebni plazmidi nazvani plazmidi faktora F uključeni su u bakterijsku konjugaciju, što je seksualna metoda reprodukcije.
Plazmidi se koriste kao vektori u rekombinantnoj DNK tehnologiji i kloniranju gena. Plazmidi posjeduju posebna svojstva koja ih čine pogodnim za upotrebu kao rekombinantni vektori u genetskom inženjeringu. Sadrže podrijetlo replikacije, selektivne markerske gene, dvolančane naravi, male veličine i višestruka mjesta kloniranja. Istraživači mogu lako otvoriti plazmidnu DNK i umetnuti željene fragmente ili gene DNA u plazmide kako bi napravili rekombinantnu DNK. Pored toga, transformacija rekombinantnog plazmida u bakteriju domaćina je lakša od ostalih vektora.
Slika 01: Plazmidi
Transposon je fragment ili niz DNK koji može translocirati u genomu bakterija. Oni su mobilni nizovi DNK. Oni se sele na nova mjesta genoma. Ovi pokreti dovode do promjene u slijedu bakterijskog genoma, uzrokujući značajne promjene u genetskim informacijama. Oni su prijenosni genetski elementi odgovorni za uspostavljanje novih genetskih nizova u bakterijama. Transpozone je prva otkrila Barbara McClintock u četrdesetim godinama 20. stoljeća eksperimentima s kukuruzom, a za svoj rad dobila je Nobelovu nagradu.
Transpozoni se ponekad nazivaju i skaklim genima jer ovi skakački nizovi mogu blokirati transkripciju gena i preurediti genetski materijal bakterije. Oni su odgovorni i za kretanje gena otpornosti na lijekove, gene za rezistenciju na antibiotike između plazmida i kromosoma.
Tamo su dvije vrste transpozona na temelju mehanizma koji koriste za pomicanje i umetanje. Oni su transposon klase I (retrotransposoni) i transposon klase II (DNA transpozoni). Transpozoni klase I koriste mehanizam 'kopiraj i zalijepi', dok transpozoni klase II koriste 'mehanizam za rezanje i lijepljenje'.
Transposon se može kretati od plazmida do kromosoma ili između dva plazmida. Zbog tih kretanja geni se miješaju između bakterijskih vrsta. Stoga se transpozoni koriste kao vektori u genetskom inženjeringu za uklanjanje i integraciju genetskih nizova u organizme.
Slika 02: Transpozon bakterijske DNA
Plasmid vs Transposon | |
Plazmid je mali kružni dvostruki neromosomalni DNA bakterija. | Transposon je segment DNA koji se može preseliti na nova mjesta unutar genoma. |
Self-Replikacija | |
Plazmidi su sposobni da se repliciraju neovisno od kromosomske DNK. | Transposoni se ne mogu samostalno replicirati. |
Posebne karakteristike Kodirano | |
Plazmidi pružaju nekoliko značajki poput otpornosti na antibiotike i virulencije. | Transposoni ne kodiraju posebne osobine. |
Koristite kao vektor | |
Plazmidi se koriste kao vektori u genetskom inženjeringu za izradu rekombinantne DNA. | Transposoni se također koriste kao vektori u genetskom inženjeringu za umetanje mutageneze. |
Mutacije i promjene u slijedu | |
Plazmidi nisu u stanju uzrokovati značajne mutacije i mijenjati redoslijed i veličinu genoma. | Transpozicija može stvoriti značajne mutacije i promijeniti redoslijed i veličinu genoma. |
Plazmid je ekstrahromosomska DNK koja se obično nalazi u bakterijama. Ima sposobnost da se nezavisno replicira iz bakterijske kromosomske DNK. Plazmidi sadrže gene koji bakterijama daju genetske prednosti. Međutim, plazmidna DNA nije bitna za preživljavanje bakterija. Transposoni su mobilni genetski elementi koji skaču s jedne lokacije na novu lokaciju unutar genoma. Oni su u stanju izazvati mutacije i promijeniti veličinu i redoslijed genoma. To je razlika između plazmida i transposona.
Referenca:
1. Griffiths, Anthony JF. "Prokariotski transpozoni." Uvod u genetsku analizu. 7. izdanje Američka nacionalna medicinska knjižnica, 01. siječnja 1970. Web. 26. travnja 2017
2. "Epizomi, plazmidi, redoslijedi umetanja i transpozoni." Svijet mikrobiologije i imunologije. Encyclopedia.com, n.d. Mreža. 27. travnja 2017
Ljubaznošću slike:
1. "Plasmid (engleski)" Korisnik: Spaully na engleskoj wikipediji - Vlastiti rad (CC BY-SA 2.5) putem Commons Wikimedia
2. "Kompozitni transpozon" Jacek FH - samostalno izrađen, na osnovu slike: Composite transposon.jpg (CC BY-SA 3.0) preko Commons Wikimedia