Filogenija je važno polje koje kroz život istražuje život na zemlji. Otkriva povezanost organizama s njihovim precima i potomcima. Odnosi među organizmima dijagramički su prikazani različitim prikazima nalik na drveće, poput dendograma, kladograma, fenograma, filograma itd. Filogenetsko stablo je granasti oblik dijaloga koji je razgranat, što objašnjava filogenetske odnose između organizama s količinom evolucijske udaljenosti. Postoje dvije glavne vrste filogenetskih stabala poznatih kao ukorijenjeno i ukorijenjeno. Ključna razlika između ukorijenjenog i ukorijenjenog filogenetskog stabla je u tome ukorijenjeno stablo prikazuje najosnovnije pretke stabla dok Neukorijenjene filogenetsko stablo ne pokazuje korijen predaka.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključne razlike
2. Što je ukorijenjeno filogenetsko stablo
3. Što je nekorijenjeno filogenetsko stablo
4. Usporedna usporedba - ukorijenjena u odnosu na nekorijenjeno filogenetsko drvo
5. Sažetak
Ukorijenjeno filogenetsko stablo služi kao koristan dijagram koji prikazuje evolucijsku povijest. Ima bazalni čvor koji se naziva korijen, koji predstavlja zajedničkog pretka svih skupina stabla. Korijen stabla smatra se najstarijom točkom na stablu koja predstavlja posljednjeg zajedničkog pretka svih skupina koje su uključene u stablo. Dakle, ukorijenjeno stablo pokazuje smjer evolucijskog vremena. Od jedne vrste ukorijenjenog stabla, uobičajeni rod ili predak vrsta može se pronaći pomicanjem do bazalnog čvora. Budući da ukorijenjeno stablo prikazuje smjer evolucijskog vremena, lako je pronaći starije ili novije skupine koje ima. Ukorijenjeno stablo može se koristiti za proučavanje cijelih skupina organizama. Precizno ukorjenjivanje filogenetskog stabla važan je i presudan čimbenik jer pogrešno ukorijenjivanje može rezultirati pogrešnim tumačenjima genetskih promjena između organizama i njihove usmjerenosti evolucije..
Slika 01: Ukorijenjeno filogenetsko stablo
Nekorijenjeno filogenetsko stablo je filogenetski dijagram kojem nedostaje zajednički predak ili bazalni čvor. Ova vrsta stabla ne naznačuje podrijetlo evolucije interesnih grupa. Prikazuje samo odnos između organizama bez obzira na smjer evolucijske vremenske linije. Stoga je teško proučavati evolucijske odnose skupina s obzirom na vrijeme koristeći neko ukorijenjeno stablo.
Postoje dva glavna načina za ukorijeniti nekorijenjeno filogenetsko stablo. Oni su
Slika 02: Nekorijenjeno filogenetsko stablo
Ukorijenjeno vs nekorijenjeno filogenetsko drvo | |
Ukorijenjeno filogenetsko stablo je dijagram koji prikazuje posljednjeg zajedničkog pretka skupina. | Nekorijenjeno filogenetsko stablo prikazuje odnose između organizama bez prikazivanja zajedničkog pretka. |
Čvor | |
Ima čvor (korijen). | Nema čvor. |
Smjer evolucije | |
Ima smjer koji označava evolucijsko vrijeme. | Ne određuje evolucijski odnos. |
Odnos prema drugima | |
Stablo omogućuje određivanje odnosa predaka i potomka između skupina. | Stablo ne dopušta da govori o odnosu predaka i potomka. |
Filogenetsko stablo predstavlja evolucijske puteve i veze između organizama koristeći razgranate dijagrame nalik na drveće. Filogenetski tras može biti ukorijenjen ili ukorijenjen. Ukorijenjeno stablo ima čvor u dnu, koji predstavlja zajedničkog pretka koji povezuje sve interesne skupine. Nekorijenjeno stablo prikazuje odnose između organizama. Međutim, on ne prikazuje zajedničkog pretka kojeg dijele sve skupine. To je razlika između ukorijenjenog i nekorijenjenog filogenetskog stabla.
Reference:
1. Činjenice o „drveću“: Ukorijenjene u odnosu na nekorijenjena stabla. “ Nacionalni centar za biotehnološke informacije. Američka nacionalna medicinska knjižnica, n.d. Mreža. 04. april 2017
2. Graham, Sean W., Richard G. Olmstead i Spencer C. H. Barrett. "Ukorjenjivanje filogenetskih stabala s udaljenim grupama: studija slučaja komelinoidnih monokota." Molekularna biologija i evolucija. Oxford University Press, 01. listopada 2002. Web. 04. april 2017