Allotropes različite su strukturne modifikacije elementa dok izomeri kemijski su spojevi koji dijele istu molekularnu formulu, ali imaju različite strukturne formule.
Određeni elementi mogu postojati u dva ili više različitih oblika. Ti se oblici nazivaju allotropes u kojem su atomi elementa povezani na različit način. Na primjer, dioksigen (O2), ozon (O3), tetraoksigen (O4) i oktaoksigen (08) su
I alotropija i izomerija bili su koncepti koje je predložio švedski znanstvenik Jöns Jakob Berzelius. Predložio je koncept alotropija 1841. Nakon prihvaćanja Avogadrove hipoteze 1860. shvatilo se da elementi mogu postojati kao poliatomske molekule, a dva alotropa kisika su prepoznata kao O2 i O3. Početkom 20. stoljeća prepoznato je da su i drugi slučajevi poput ugljika nastali zbog razlika u kristalnoj strukturi.
Izomerizam je prvi put primijećen 1827., kada je Friedrich Woehler pripremio cijaninsku kiselinu i napomenuo da je, iako je njegov elementarni sastav identičan fulmininskoj kiselini (koju je pripremio Justus von Liebig prethodne godine), njegova svojstva bila sasvim drugačija. Ovo je otkriće dovelo u pitanje prevladavajuće kemijsko razumijevanje vremena, koje je smatralo da kemijski spojevi mogu biti različiti samo ako imaju različite elementarne sastave. Nakon što su učinjena dodatna ista otkrića, poput Woehlerovog otkrića iz 1828. godine, da urea ima isti atomski sastav kao kemijski različit amonijev cijanat, Jöns Jakob Berzelius uveo je pojam izomera opisati pojavu.
Različite klase izomera uključuju stereoizomere, enantiomere i geometrijske izomere.
Vrste izomera