Iako je teorijska termodinamika interakcija antigen-antitijelo dobro poznata, njihova praktična primjena u otkrivanju ili određivanju autoantitijela je mala. Za funkcionalna antitijela, određivanje optimalnog afiniteta omogućava postizanje maksimalne terapijske koristi. Afinitet antitijela proučavan je gotovo pola stoljeća, a od nastanka afinitetne kromatografije prije tri desetljeća razvio se u moćno sredstvo. Afinitet opisuje interakciju na pojedinačnom mjestu vezanja. Poznavanje afiniteta, kao i svojstava konstrukta i antigena bitno je za procjenu veze između afiniteta i potencijala za funkcionalno antitijelo. Međutim, pored afiniteta, postoji još jedan koncept vezanja koji se naziva avidity, a to je ukupna snaga vezanja interakcije između multivalentnog antigena i multivalentnog antitijela. Unatoč jasnim razlikama između njih dvojice, pojmovi afinitet i pohlepnost često se neselektivno koriste. Pogledajmo ovo dvoje.
Afinitet je sila vezanja paratopa molekule jedne antitijela s pripadajućim epitopom na molekuli antigena. Opisuje interakciju na pojedinačnom mjestu vezanja. Poznavanje afiniteta, kao i svojstava konstrukta i antigena bitno je za procjenu veze između afiniteta i potencijala za funkcionalno antitijelo. Temelji se na istim termodinamičkim principima koji reguliraju bilo koju reverzibilnu biomolekularnu interakciju, istu snagu vezanja koja omogućava vašem imunološkom sustavu da se bori protiv infekcija. A snaga se odnosi na čvrstoću specifične veze između antitijela i njegovog antigena. Precizna i precizna procjena afiniteta za interakciju antigen-antitijelo važno je za utvrđivanje granica afiniteta i gornje granice terapijskog antitijela. U termodinamičkom pogledu, afinitet se izražava kao zbroj svih privlačnih sila što rezultira povećanom čvrstoćom vezanja i odbojnim silama što rezultira smanjenom čvrstoćom vezanja..
Poklonost je još jedan obvezujući pojam koji se često miješa s afinitetom; zapravo se oba termina odnose na pojam čvrstoće vezanja, osim što se avidnost odnosi na ukupnu snagu antigen-vezujućeg kapaciteta smjese poliklonalnih antitijela. Dostupnost dolazi do izražaja kada se multivalentni antigen veže na bivalentno antitijelo u otopini ili kad se antitijelo veže na dvije monovalentne molekule antigena na površini. Za razliku od afiniteta, avidnost opisuje multivalentno vezivanje između više mjesta vezanja liganda, odnosno ligata. Jednostavno rečeno, avidnost je sila vezivanja između multivalentnog antitijela i multivalentnog antigena. Postupnost se ne može opisati termodinamičkim izrazima, a dobiva se kinetičkim mjerenjima. Avidnost antitijela ovisi o afinitetima pojedinih mjesta vezanja antitijela, ali veća je od afiniteta vezanja jer se sve interakcije antitijelo-antigen moraju razbiti istovremeno da se antitijelo potpuno disocira..
Izrazi afinitet i avidnost ponekad se neprimjereno upotrebljavaju kao sinonimi. U stvari, oba se termina odnose na pojam čvrstoće vezivanja. Afinitet se u termodinamičkim terminima definira kao mjerenje stupnja povezanosti između antitijela i antigena, dok se ukupna snaga koja veže multivalentno antitijelo na multivalentni antigen naziva aviditet ili na drugi način poznat kao "funkcionalni afinitet". Afinitet je jačina vezanja antitijela koje kombinira mjesto na jedan odgovarajući epitop antigena, dok je avidnost ukupna snaga sposobnosti vezanja antigena smjese poliklonalnih antitijela. Poklonost se naziva i funkcionalnim afinitetom.
Pojam afinitet označava konstantu unutarnje povezanosti između antitijela i univalentnog liganda kao što je hapten, dok se termin aviditet koristi za označavanje ukupne energije vezanja između antitijela i multivalentnog antigena. Konstanta povezivanja je mjera afiniteta antitijela za epitop. Postupnost se ne može opisati termodinamičkim izrazima, a dobiva se kinetičkim mjerenjima. U termodinamičkom pogledu, afinitet se izražava kao zbrajanje energije bliskog raspona intermolekularnih privlačnih i odbojnih sila između antigenske determinante i njezinog mjesta vezanja.
Afinitet antitijela može igrati kritičnu ulogu u određivanju bioloških aktivnosti antitijela. Dakle, potrebno je biti u mogućnosti karakterizirati odgovor antitijela u smislu afiniteta kao i veličine, a također razumjeti i kako afinitet antitijela može utjecati na određeni test. Izraz avidity ponekad se koristi sinonimno s afinitetom, ali najčešće se koristi za opisivanje sposobnosti antitijela da formiraju stabilne komplekse s antigenom. Postupnost je akumulirana snaga višestrukih afiniteta pojedinih mjesta vezanja antitijela.
Unatoč njihovim razlikama, često se neselektivno koriste izrazi afinitet i sklonost. Afinitet je sila vezanja paratopa molekule jedne antitijela s pripadajućim epitopom na molekuli antigena i može se odrediti samo jednim monovalentnim Fab fragmentom. To je zbroj svih privlačnih sila što rezultira povećanom čvrstoćom vezanja i odbojnim silama što rezultira smanjenom čvrstoćom vezanja. S druge strane, avidnost je sila vezivanja između multivalentnog antitijela i multivalentnog antigena, a naziva se i funkcionalnim afinitetom. Izmjerena energija vezivanja između antitijela i njihovih odgovarajućih antigena odražava avidnost antitijela. Za razliku od afiniteta, avidnost se ne može opisati termodinamičkim izrazima, a dobiva se kinetičkim mjerenjima.