Okazaki fragmenti vs zaostali niz
"Okazaki fragmenti" i "zaostali niz" izrazi su koji se često koriste u kemiji. Vjerojatno ste čuli puno o fragmentima okazakija i zaostalom strukom u vašem razredu kemije. Pa to je samo ako pažljivo slušate svog profesora. Ovaj članak služi kao osvježivač o tome o čemu se radi ulomke okazakija i zaostali niz.
Okazaki fragmenti i zaostali niz razmatraju se dok je u pitanju replikacija DNK. Prije svega, replikacija DNA definira se kao biološki proces koji se odvija u svim živim organizmima i kopira njihov DNK. DNA je, s druge strane, osnova za biološko nasljeđivanje.
Tijekom replikacije DNA nastaju fragmenti okazaki. Ovi fragmenti okazaki izgledaju relativno kratko. Oni se smatraju krajnjim proizvodima ili tek sintetiziranim fragmentima DNK koji nastaju na zaostalom lancu. Jednostavno rečeno, fragmenti okazaki nastaju na zaostalom niti. Zaostajuči niz definiran je kao pramen DNK koji se neprestano replicira iz smjera od pet stopa do tri stope. Smjer od pet do tri stope je usmjerenost u molekularnoj biologiji.
Okazaki fragmenti su komplementarni nizu koji zaostaje. Bez njih neće biti formiranja kratkih, dvovezanih odsječaka DNK. Ako želimo odrediti duljinu fragmenata okazaki, oni se kreću od 1.000 do 2.000 nukleotida u Escherichia coli, vrsti bakterija koje se obično nalaze u crijevima toplokrvnih organizama. Ulomak Okazaki mjeri između 100 do 200 nukleotida u eukariotima, organizmima koji imaju složene stanične strukture.
Svaki od okazaki fragmenata razdvojen je RNA primerima. A ako se uklone RNA primeri, enzim koji se zove ligaza spojit će fragmente okazakija zajedno kako bi tvorio novo sintetizirani komplementarni lanac.
Kao što smo već rekli, okazaki fragmenti i zaostali niz nadopunjuju se jedan s drugim. No, postoji još jedan lanac DNA koji igra vrlo važnu ulogu tijekom procesa replikacije DNK. Naziva se vodećim nizom. Ako je zaostali niz definiran kao da se ponavlja bez prestanka, vodeći struk ide obrnuto. Replicira se kontinuirano. Prisutnost vodećeg lanca omogućava odmotavanje roditeljske dvolančane DNK. Jednostavno rečeno, ruta koju nudi vodeći niz kontinuirana je.
Tijekom replikacije DNK, žice treba vezati u smjeru od pet do tri stope. S nesmetanom i neprekidnom rutom vodećeg poteza neće biti problema. Ali kad je riječ o zaostalom lancu, budući da je riječ o antiparalnom smjeru DNK, on ne može biti kontinuiran. Da bi se kompenzirali, zaostajući pramenovi proizvode se kao kratki niti uz komplementarnu pomoć fragmenata okazaki. Sasvim je normalno da se lanci DNA kreću u suprotnim smjerovima, jer je struktura DNK dvostruka spirala. Budući da je zaostali niz u antiparalnom smjeru, njegova polimeraza funkcionira radeći unatrag prema replikacijskoj vilici i u kratkim komadima.
Fragmente okazakija i ostale pridružene procese u procesu replikacije DNK otkrili su Kiwako Sakabe i Reiji Okazaki 1966. godine. Oni su napravili istraživanje vezano za proces replikacije DNK bakterije, Escherichia coli.
Sažetak: