Audio CD-i pohranjuju se u mediju u izvornom nekomprimiranom obliku brzinom prijenosa od 1411bit / sec. MP3 CD-ovi pohranjuju se komprimirani s brzinom bita, koja iznosi oko 64 do 256 bita u sekundi. Primarna prednost MP3 CD-ova je velika razlika u broju datoteka pohranjenih na jednom disku. To se može kretati na stotine u usporedbi s 15 do 20 pjesama koje se mogu pohraniti na audio CD.
Audio CD-ovi već duže vrijeme su standard u prijenosnim glazbenim formatima. Bio je to prvi format koji je glazba kodirana, i kao takav svi glazbeni playeri koji prihvaćaju CD mogu reproducirati ovaj vrlo osnovni format. Jedna prednost koju audio CD-ovi imaju u odnosu na MP3 CD-ove je kvalitetan zvuk koji audio CD-ovi mogu isporučiti. Nekomprimirani format znači da se niti jedan od podataka ne gubi uslijed kompresije. Hardver potreban za reprodukciju audio CD-ova je jednostavniji u usporedbi s MP3 playerima.
MP3 CD-i pojavili su se na sceni kratko vrijeme nakon uvođenja formata. MP3 je gubitak metoda kompresije audio datoteka. To znači da neke podatke treba odbaciti da bi se znatno smanjila veličina datoteke. Jedini dobar aspekt MP3 datoteke jest činjenica da može biti desetina veličine iste datoteke u audio CD formatu. Gubitak zvučnih informacija znači da su MP3-i primjetno inferiorniji od audio CD-ova kada se reproduciraju u zvučnoj opremi vrhunskog zvuka; iako je razvoj boljih kodeka postupno smanjivao jaz između to dvoje.
Velika razlika između audio CD-a i MP3 CD-a može doći iz hardvera za oba formata. Kao što je gore navedeno, svi uređaji mogu reproducirati audio CD-ove, ali to možda nije baš slučaj s MP3 CD-ovima. Iako je u posljednjih nekoliko godina porastao broj uređaja koji mogu reproducirati MP3 CD-ove, još uvijek nije tako uspostavljen kao oblik audio CD-a. A trenutni trend MP3 playera koji i sami djeluju kao medij za pohranu dodatno je oslabio podršku za prijenosne CD playere koji podržavaju MP3 format.
Trenutno su MP3 datoteke najrašireniji format kada je riječ o prijenosnim uređajima za reprodukciju unatoč naglom padu MP3 CD-ova. Audio CD format i dalje ima veliku prisutnost na tržištu jer je i dalje preferirani medij u prodaji glazbenih albuma.