Razlika između VNTR i sonde

ključna razlika između VNTR i sonde je to VNTR je kratki nukleotidni niz koji se pojavljuje kao tandem ponavljanje u genomu dok je sonda umjetno sintetizirana kratka sekvenca DNA ili RNA koja se može radioaktivno označiti.

VNTR označava ponavljanje tandema s promjenjivim brojem. To je kratki nukleotidni niz organiziran u tandemskim ponavljanjima u genomu. VNTR se prirodno javljaju u našem genomu. Sonda je umjetno sintetizirana kratka sekvenca DNA ili RNA. I sonda i VNTR su nukleinske kiseline ili kratke nukleotidne sekvence. Imaju ogromnu upotrebu u različitim molekularno-biološkim tehnikama, uglavnom u forenzičkim studijama. VNTR i sonda imaju neke sličnosti kao i razlike. Stoga članak pokušava ukazati na razliku između VNTR i sonde.

SADRŽAJ

1. Pregled i ključne razlike
2. Što je VNTR
3. Što je sonda
4. Sličnosti između VNTR i sonde
5. Usporedna usporedba - VNTR i sonda u tabličnom obliku
6. Sažetak

Što je VNTR?

VNTR je kratki nukleotidni niz koji postoji kao tandem ponavljanje u našem genomu. VNTR su prisutni u mnogim kromosomima. Nadalje, VNTR-ovi se kod različitih pojedinaca razlikuju po duljini jer je broj ponavljanja različit kod VNTR-a različitih ljudi. U osnovi, to je zbog alela naslijeđenih od njihovih roditelja. Stoga VNTR uglavnom koristimo za roditeljsku identifikaciju (nasljeđivanje) ili u osobne svrhe. Slično tome, moguće ih je koristiti i u genetici, forenzici, biološkim istraživanjima i DNK otiscima prstiju. Stoga je VNTR važan alat u molekularnoj biologiji.

Slika 01: VNTR

U nasljeđivanju analiziramo VNTR podatke koristeći dva osnovna principa: nasljeđivanje i podudaranje identiteta. Tijekom podudaranja nasljedstva pojedinac mora imati alel podudaranja s onim od svakog roditelja. Tijekom podudaranja identiteta, oba alela VNTR moraju biti prisutna na određenom mjestu genoma.

Što je sonda?

U kontekstu molekularne biologije, sonda je umjetno sintetizirani fragment DNA ili RNA, duljine od 100 do 1000 baza. Radioaktivno možemo označiti ove sonde. Stoga ih koristimo za otkrivanje ciljanih nukleotidnih nizova koji su komplementarni slijedu sonde. Kada uzorak dodamo sonde, vrši se hibridizacija s komplementarnim sekvencama ili ciljnim nizovima i olakšava nam identificiranje ciljnih sekvenci. Budući da sonde nose radioaktivnost, možemo ih lako otkriti.

Slika 02: Sonda

U forenzičkoj znanosti najčešće koristimo sonde u tehnikama DNK profiliranja, kao što su detekcija kratkih područja ponavljanja u tandemu, polimorfizmi dužine restrikcijskog fragmenta i DNK otisci prsta.

Koje su sličnosti između VNTR i sonde?

• Nukleinske kiseline su građevni blokovi VNTR i Sonde.
• Koristimo ih u postupcima identifikacije gena.
• Također su obje njihove duljine promjenjive.
• Oni su važni alati u forenzičkim studijama, uzimanju otisaka DNK, genetici, itd.

Koja je razlika između VNTR i sonde?

VNTR je područje genoma organizirano kao tandem koji se ponavlja, dok je sonda kratka DNK ili RNA sekvenca umjetno sintetizirana kako bi se detektirale ciljane sekvence u uzorku. Dakle, ovo je ključna razlika između VNTR i sonde. Također, važna razlika između VNTR i sonde je da za razliku od VNTR-a, sonde možemo radioaktivno označiti.

Nadalje, VNTR uglavnom vrše roditeljsku identifikaciju dok sonde pomažu u otkrivanju ciljanih nukleotidnih nizova u DNK ili RNA uzorcima koji su komplementarni slijedu sonde. Dakle, ovo je i značajna razlika između VNTR i sonde.

Sljedeća infografija prikazuje više informacija o razlici između VNTR i sonde.

Pregled - VNTR i Sonda

Uobičajena uporaba VNTR i sonde je u tehnikama molekularne analize poput forenzičkih studija i otiska prsta DNK-om. Oba se sastoje od promjenjivih duljina. Međutim, ključna razlika između VNTR i sonde je u tome što je VNTR područje genoma raspoređeno ponavljanjem u tandemu, dok je sonda fragment DNA ili RNA koji bi mogao biti radioaktivno označen. Štoviše, VNTR su prisutni u genomu. Međutim, sonde su umjetno sintetizirane i mogu ih se označiti radioaktivno kako bi se otkrile ciljane nukleotidne sekvence u uzorcima DNK ili RNA koje su komplementarne sekvenci u sondi. Dakle, ovo je sažetak razlike između VNTR i sonde.

Referenca:

1. „Promjenjivi broj ponavljanja tandema (VNTR) i njegova primjena u bakterijskoj epidemiologiji.“ Znanstvena upozorenja: časopis, dostupan ovdje.
2. "DNK sonda." Nature vijesti, Nature Publishing Group, dostupne ovdje.

Ljubaznošću slike:

1. "D1S80Demo" napisao PaleWhaleGail na engleskoj Wikipediji (CC BY-SA 3.0) preko Commons Wikimedia
2. "Molekularne svjetionice" (CC BY-SA 3.0) putem Commons Wikimedia