Razlika između Exome i Transcriptome
Share
Ključna razlika - Exome vs Transcriptome
Gen sadrži kodirajuća i nekodirajuća područja u njemu. Sekvence kodiranja poznate su kao egzoni, a nekodirajuće sekvence poznate su kao introni. Nukleotidna sekvenca egzona gena predstavlja genetski kod gena za sintezu specifičnog proteina. Dakle, egzoni ostaju u molekuli mRNA. Ukupna egzonova regija genoma poznata je kao egzom i važan je dio genoma. Genetski kod gena pretvara se u genetski kod molekule mRNA, koji je potreban za proizvodnju proteina. Cjelokupne molekule mRNA transkribirane u stanici ili staničnoj populaciji u isto vrijeme poznate su kao transkript. Ključna razlika između exome i transcriptome je ta exome predstavlja sekvence egzonskih regija genoma dok transkript predstavlja ukupnu mRNA stanice ili tkiva u određenom trenutku.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključne razlike
2. Što je Exome
3. Što je transkript
4. Usporedna usporedba - Exome vs Transcriptome
5. Sažetak
Što je Exome?
Geni su sastavljeni od egzona, introna i regulatornih nizova. Egzoni su genske regije koje se tijekom transkripcije prepisuju u mRNA slijed. Introni i druga nekodirajuća područja uklanjaju se tijekom transkripcije. Nukleotidni niz egzona određuje genetski kod gena koji sintetizira specifični protein koji on kodira. Samo eksoni ostaju unutar mRNA proteina. Kolekcija egsona u genomu poznata je kao egzo organizma. Predstavlja dio genoma koji je izražen genima. U ljudi egzom iznosi 1% od genoma. To je dio koji kodira proteine u ljudskom genomu.
Slika 01: Exome
Što je transkript?
Transkript je skup svih transkripta koji kodiraju proteine i nekodirajuće tkivo (RNA) u određenom tkivu. Transkript predstavlja skup ukupnih molekula mRNA izražene genima u stanici ili tkivu. Transkript stanice se može mijenjati s transkriptom druge vrste stanica. Transkript je također dinamičan - mijenja se s vremenom kao odgovor na unutarnje i vanjske podražaje. Čak i unutar istog tkiva ili unutar iste vrste stanica, transkript se može promijeniti nakon nekoliko minuta.
Transkript se razlikuje od egze organizma. Transkript uključuje samo eksprimirane eksome sekvencije. Iako egzoti stanice ostaju isti, transkript se razlikuje među stanicama, jer ekspresija gena nije ista za sve stanice ili tkiva. Samo se esencijalni geni eksprimiraju u različitim stanicama i tkivima. Ekspresija gena je specifičan proces tkiva ili stanica. Reguliraju ga različiti čimbenici, uključujući faktore okoliša. Stoga transkript može varirati ovisno o vanjskim uvjetima okoliša.
Transkript se koristi kao prekursor za studije proteomike. Svi proteini su izvedeni iz mRNA sekvence. Translacijske modifikacije mogu rezultirati promjenama proteina. Međutim, transkript daje važne osnovne podatke za proteomske studije.
Slika 02: Transkript matičnih stanica embriona
Koja je razlika između Exome i Transcriptome?
Exome vs Transcriptome | |
| Primjer je skupljanje gena koji kodira protein. | Transkript je zbirka sve transkribirane RNA, uključujući mRNA. |
| Uzorak | |
| Exome se proučava pomoću uzorka DNK. | Transkript se proučava pomoću RNA uzorka. |
| Metoda ispitivanja | |
| Redoslijed cjelovitog egome metoda je metoda proučavanja exome. | Redoslijed RNA je metoda proučavanja transkripta. |
Sažetak - Exome vs Transcriptome
Egzoni su kodirajuće sekvence gena i određuju mRNA sekvence proteina. Zbir ovih nizova kodiranja (egzoni) poznat je kao uzor organizma. Geni se prepisuju u molekule mRNA prije stvaranja proteina. Ukupne molekule mRNA stanice ili tkiva u bilo kojem trenutku poznate su kao transkriptom. Transkript predstavlja gene koji se aktivno eksprimiraju u mRNA u bilo kojem trenutku. Transkript je specifičan za ćelije i tkiva i utječe na uvjete okoliša. To je razlika između egzoma i transkripta.
Reference:
1.Sarah i suradnici, „Ciljano hvatanje i masovno paralelno sekvencioniranje dvanaest ljudskih prihoda“. Priroda. Američka nacionalna medicinska knjižnica, 10. rujna 2009. Web. 01. april 2017
2.Mutz i sur. "Transkriptna analiza korištenjem slijeda sljedeće generacije." Elsevier: Lokator članaka. N.p., rujan 2012. Web. 01. april 2017
Ljubaznošću slike:
1. "Transkript pluripotentnih stanica" Grskovic, M. i Ramalho-Santos, M., The pluripotent transcriptome (10. listopad 2008), StemBook, ed. Zajednica za istraživanje matičnih ćelija, StemBook, doi / 10.3824 / matična knjiga.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Slika 2. Transkript pluripotentnih ćelija.Grskovic, M. i Ramalho-Santos, M., pluripotentni transkript (10. listopada 2008.), StemBook, ed. Zajednica za istraživanje matičnih ćelija, StemBook, doi / 10.3824 / matična knjiga.1.24.1, (CC BY 3.0) putem Commons Wikimedia
