Razlika između proteomike i metabolomike

ključna razlika između proteomike i metabolomije je to proteomika je proučavanje svih proteina organizma dok je metabolomija proučavanje svih metabolizama organizma.

Genomika je proučavanje genetskog sastava organizma. Proteomika i metabolomija dvije su omicke znanosti povezane s genomikom. Proteome se odnosi na sve proteine ​​u stanici ili organizmu. Metabolome se, s druge strane, odnosi na sve metabolite u organizmu. Dakle, proučavanje proteoma je proteomika, dok je proučavanje metaboloma metabolomika. I proteomika i metabolomija važni su u dijagnostici bolesti i karakterizaciji i probiranju organizama. Štoviše, obje su povezane u mnogim aspektima stanične biologije, posebno u staničnoj signalizaciji, razgradnji proteina i stvaranju i post-translacijskoj modifikaciji..

SADRŽAJ

1. Pregled i ključne razlike
2. Što je Proteomics
3. Što je metabolomija
4. Sličnosti između proteomike i metabolomike
5. Usporedna usporedba - Proteomics vs Metabolomics u tabelarnom obliku
6. Sažetak

Što je Proteomics?

Proteom je ukupni proteinski komplement u stanici, tkivu ili organizmu. Dakle, proteomika je proučavanje proteoma organizma. U proteomici se analiziraju različite karakteristike proteina. Stoga se proteomika uglavnom fokusira na strukturu, orijentaciju, funkcije, interakcije proteina, modifikacije, primjene i važnost proteina. Zato se trenutno provode mnogi istraživački projekti iz područja proteomike.

Prve proteomske studije rađene su da bi se utvrdio sadržaj proteina u Escherichia coli. Mapiranje ukupnog sadržaja proteina izvedeno je korištenjem dvodimenzionalnih (2D) gelova. Nakon uspjeha ovog projekta, znanstvenici su prešli na karakterizaciju ukupnog sadržaja proteina u životinjama poput zamoraca i miševa. Trenutno se preslikavanje proteina čovjeka provodi pomoću 2D gel elektroforeze.

Mnogo je prednosti proučavanja proteomike jer su proteini vladajuće molekule većine aktivnosti zbog svojstva proteina katalizatora. Dakle, proučavanje čitavih proteina može pružiti informacije o zdravstvenom stanju organizma. Štoviše, proteomika ima mnogo primjena u annotaciji genoma, identifikaciji bolesti i dijagnostici, provođenju studija ekspresije proteina tijekom eksperimentiranja i modifikacija proteina te studija interakcija, itd..

Slika 01: Proteomika

Postoje različite tehnike koje su uključene u proteomiku, uključujući ekstrakciju ukupnog proteina, njihovo razdvajanje pomoću 2D gel elektroforeze, sekvencioniranje ekstrahiranih proteina metodama poput Edmundove metode sekvenciranja ili masenom spektrometrijom i analizu strukturnih i funkcionalnih svojstava proteina upotrebom računalno utemeljeni softver i bioinformatički alati.

Što je metabolomija?

Metabolomika je proučavanje svih metabolita u stanici, tkivu ili organizmu. To uključuje identifikaciju i kvantifikaciju staničnih metabolita pomoću različitih naprednih analitičkih i statističkih alata. Metabolomija je važno istraživanje jer otkriva podatke o metabolizmu u organizmu.

Slika 02: Metabolomika

Za proučavanje supstrata i produkata metaboličkih reakcija, metabolomika koristi masenu spektrometriju kao analitičku platformu. Masenom spektrometrijom nastaju metaboliti i njihove koncentracije, što odražava stvarno biokemijsko stanje stanica ili tkiva. Stoga se metabolomija može smatrati najboljim prikazom molekularnog fenotipa u organizmu. Pored njih, metabolomika se može smatrati produženjem proteomika jer se većina metabolita stvara zbog aktivnosti enzima koji su bjelančevine.

Koje su sličnosti između proteomike i metabolomike?

• Proteomika i metabolomija dvije su omicke znanosti povezane s genomikom.
• Metabolomika se može smatrati produžetkom proteomike.
• Proteome i metabolome usko su povezani s mnogim studijama.

Koja je razlika između proteomike i metabolomike?

Proteomics je opsežno istraživanje proteina, uključujući njihovu strukturu i funkciju, u stanici ili organizmu. U međuvremenu, metabolomija je proučavanje profila metabolizma u stanici, tkivu ili organizmu u određenom skupu uvjeta. Dakle, to je ključna razlika između proteomike i metabolomike. Osim toga, proteomika se uglavnom odnosi na kompletan skup proteina, dok se metabolomika uglavnom odnosi na kompletan skup metabolita, uključujući raznoliku lepezu malih molekula poput peptida, ugljikohidrata, lipida, nukleozida i kataboličkih produkata egzogenih spojeva itd. Stoga je ovo još jedna razlika između proteomike i metabolomike.

Podaci u nastavku rezimiraju razliku između proteomike i metabolomike.

Sažetak - Proteomics vs Metabolomics

Živi organizmi se mogu proučavati pomoću njihovog genoma, proteina i metabolita. Genomika, proteomika i metabolomija su tri područja koja proučavaju genetski sastav, proteine ​​i metabolite stanice ili organizma. Proteomika je važna jer predstavlja dinamički odraz i gena i okoliša. Metabolomika je vrlo važna jer izravno odražava trenutni status biokemijske reakcije stanica ili metabolički status organizma. Dakle, ovo sažima razliku između proteomike i metabolomike.

Referenca:

1. P, Surat. "Kako su metabolomi i proteomi povezani?" Vijesti, 26. veljače 2019, dostupno ovdje.
2. Horgan, Richard P i Louise C Kenny. „SAC pregled„ Omićevih “tehnologija: genomika, transkriptomija, proteomika i metabolomika.“ Akušerstvo i ginekologija, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18. srpnja 2011., dostupno ovdje.

Ljubaznošću slike:

1. "Proteomics" Xxl7441 u engleskim Wikibooks - prebačen iz en.wikibooks u Commons. (Javna domena) putem Commons Wikimedia
2. „Metabolomska shema“ Lmaps (razgovor) - ovo djelo sam u cijelosti stvorio sam (CC BY-SA 3.0) putem Commons Wikimedia