Protochordata i Euchordata su dvije glavne skupine Phylum Chordata; stoga, prije nego što naučimo razliku između Protochordata i Euchordata, prvo ukratko raspravimo o Chordata. Hordati su najnaprednija i vjerojatno najpoznatija skupina organizama u čitavom životinjskom kraljevstvu, uključujući ljude. Oni su dvostrani, deuterostomialni eukoelomati. Najvažnije karakteristike hordata uključuju prisutnost dorzalne šuplje živčane vrpce, notokorda i ždrijelnih žljezda. Ove su karakteristike prisutne u svim hordatama u bilo kojoj fazi njihovog života. Ostale napredne značajke koje pomažu hordate da dominiraju nad drugom Phylom su prisutnost živog endoskeleta, učinkovito disanje, učinkovita cirkulacija i centralizirani živčani sustav. Postoje tri glavne podfile pronađene u Phylum Chordata, naime; Urochordata, Cephalochordata i Vertebrata. Od ove tri, prve dvije podfile zajedno se nazivaju Protochordata, što uključuje niže / primitivne kordate. Kralježnjaci su klasificirani kao eukordati koji uključuju više korda.
Protohordati se sastoje od organizama koji su pod kategorizacijom Subfila Urochordata i Cephalochordata. Protohordati su naziva se i Acraniata, zbog nedostatak glave i kranija. Ti su organizmi izrazito morski i imaju tijela male veličine.
Eukordati su viši kordati koji uključuju i životinje Subphyla Vertebrata. Za razliku od protohordata, euhordati imaju istaknutu glavu i lobanju, dakle zvani Craniata. Subfila vertebrata podijeljena je u dvije skupine; (A) besčeljusnjače, što uključuje životinje kojima nedostaju prave čeljusti i upareni dodaci i (b) čeljustouste, koji uključuje kralježnjake s pravim čeljustima i uparenim prilozima.
• Protokordati se nazivaju i Acraniata zbog nedostatka glave i kranija. Eukordati se nazivaju Craniata zbog prisutnosti glave i kranija.
• Protokordati su isključivo morski s malim tijelima, dok se eukordati nalaze u vodenim i kopnenim staništima i imaju tijela velikih veličina.
• Euchordates imaju dobro razvijenu glavu i egzoskelet s 2 para dodataka. Međutim, protohordatima nedostaju prilozi i egzoskelet.
• Protohordati imaju enterokoelni kolom, dok eukordati imaju shizokoelni kolom.
• Protohordatima nedostaje kralježak, za razliku od eukordata.
• Za razliku od protohordata, notoord je u euordatama prekriven ili zamijenjen kralježničkim stupom.
• Protokordati imaju grkljan sa trajnim škrgama. Ždrijelni žlijezdi euhordata ustraju ili nestaju.
• Protohordati imaju manje komore, ali eukordati imaju srca s komorama (2 do 4 komore).
• bubrezi u protohordatima sadrže protonefridiju, dok u eukordatima bubrezi sadrže mezo- ili metanefridije.
• Umnožavanje protohodata bilo je seksualno ili aseksualno, dok je eukordata uvijek seksualno.
• Gonodukti su obično odsutni u protohordama, dok su uvijek prisutni u eukordatama.
• Kod eukordata razvoj je neizravan ili izravan, sa ili bez ličinke, dok je kod protohordata razvoj neizravan sa stadijom larve bez plivanja..
Ljubaznošću slika: