Razlika između YAC i M13 fag vektora

Ključna razlika - YAC u odnosu na M13 fazni vektor
 

Kloniranje DNK važan je proces koji omogućava razmnožavanje važnih fragmenata DNK u organizmima. Za stvaranje rekombinantne DNK koja se transformira u organizam domaćina zahtijeva spajanje specifične DNA s vektorskom DNK. Vektor je molekula DNA koja se ponaša kao sredstvo za prenošenje stranog genetskog materijala u drugu stanicu ili organizam. Trebao bi se moći razmnožavati u organizmu domaćina i stvarati višestruke kopije rekombinantne DNA. Postoje različite vrste vektora koji se koriste u kloniranju DNK. Umjetni kromosom kvasca (YAC) i fazni vektor M13 dvije su vrste. Ključna razlika između YAC i M13 fag vektora je ta YAC je umjetni kromosom koji se razmnožava u stanicama kvasca dok M13 fag vektor je jednolančana kružna DNA bakteriofaga M13 koja se replicira u E coli Stanice.

SADRŽAJ
1. Pregled i ključne razlike
2. Što je YAC
3. Što je M13 fazni vektor
4. Usporedna usporedba - YAC i M13 Phage Vector
5. Sažetak

Što je YAC Vector?

YAC je umjetno izgrađen kromosom koji ima mogućnost nošenja velikog segmenta strane DNK i umnožavanja unutar stanica kvasca. Ima centromere, telomere i autonomno replicirajuće sekvence neophodne za replikaciju i stabilnost. YAC također treba nositi selektivni marker ili biljege i mjesta restrikcije kako bi ga učinio učinkovitim vektorom kloniranja. Veliki nizovi od 1000 kb do 2000 kb mogu se umetnuti u YAC i prenijeti u kvas.

Slika 01: YAC Vector

Što je fazni vektor M13?

Bakteriofag M13 je virus koji se zarazi i razmnožava u E coli. Genom bakterije M13 bakteriofaga je malih dimenzija, oko 6,7 kb. To je jednolančani, kružni i pozitivni DNK. Ovaj virus posebno zarazi E coli bakterija kroz F pilus. Jednom kada uđe u ssDNA u bakteriju, sintetizira njezin komplementarni lanac i postaje dsDNA ili replikativni oblik (RF) M13. RF se može ponašati poput plazmida u organizmu domaćina. DsDNA se replicira unutar E coli i proizvodi ssDNA koja nosi nove fage. Ovi novi fagovi se neprekidno oslobađaju E coli bez ubijanja stanice domaćina. Međutim, infekcija usporava rast E Coli. dsDNA se može ekstrahirati iz bakterijskih stanica i koristiti kao vektori u kloniranju DNA. Poznati su kao fazni vektori M13. Njima se lako može manipulirati i koristiti slično kao plazmidni vektori.

Inherentna sposobnost infekcije ovih M13 faga služi kao dobra kvalifikacija za upotrebu kao vektora u kloniranju gena. Kada se M13 razvija u vektor, u njegov genom treba ugraditi nekoliko elemenata. Oni su, gen za protein lac repressor (lac I), operativno-proksimalno područje lac Z gen, lac promotor i mjesto višestrukog kloniranja (polilinker). Kada se dsDNA M13 koristi kao vektori, ona se može tretirati kao vektor plazmida. Međutim, primjena ssDNA M13 ima prednosti u sekvenciranju DNK i mutagenezi usmjerenoj na mjesto.

Budući da faktor M13 fag nosi više mjesta kloniranja u lacZ regiju, rekombinirani vektori mogu se lako identificirati prekrivanjem plavo / bijele kolonije na agarnim pločama koje sadrže IPTG i X-Gal. Plavi plakovi proizvedeni na pločama ne sadrže rekombinirane fagove. Stoga se u svrhu kloniranja mogu odabrati fagi s umetcima.

Slika 02: Bakteriofag M13

Koja je razlika između YAC-a i M13 Phage Vector-a?

YAC vs M13 fazni vektor
YAC je genetski modificirani kromosom koji ima sposobnost prenošenja velikog segmenta strane DNK i umnožavanja unutar stanica kvasca..	Mg fag vektor je virusni vektor razvijen bakteriofagom M13 koji se koristi za umetanje stranih DNK u E coli.
Svrha
YAC-ovi su dizajnirani za kloniranje velikih fragmenata genomske DNK u kvasce.	M13 vektor faga koristi se za umetanje stranih DNK u E coli.
Umetnite duljinu
YAC-ovi mogu sadržavati genske umetke veličine megabaze (1000 kb - 2000 kb).	Veličina umetka je oko 1500 bps.
izgradnja
YAC DNA je teško očistiti netaknutom i zahtijeva visoku koncentraciju za generiranje YAC vektorskog sustava.	Nastaje putem cikličkog fotosintetskog lanca elektrona.
Stabilnost
YAC je nestabilan.	M13 fagovi se mogu lako izdvojiti.
Veličina
Enzimi su veće molekule.	M13 fagi su stabilni od YAC.

Sažetak - YAC vs M13 Phage Vector

YAC je umjetno izgrađen vektorski sustav koji koristi određeno područje kromosoma kvasca za umetanje velikih segmenata genetskog materijala u stanice kvasca. Mg fag vektor je vektorski sustav izveden iz bakteriofaga M 13 koji koristi E coli kao organizam domaćina. To je glavna razlika između YAC i M13 Phage Vector-a. Oboje su podjednako korisni u tehnologiji rekombinantne DNA i kloniranju gena.

Referenca:
1.”Vector„. Bilješke genetike - vektor. N.p., n.d. Mreža. 16. svibnja 2017. https://genetics-notes.wikispaces.com/Vector
2. "Kvasni umjetni kromosom." Wikipedia. Zaklada Wikimedia, 21. travnja 2017. Web. 16. svibnja 2017. .

Ljubaznošću slike:
1. "M13B" autor J3D3 - Vlastiti rad (CC BY-SA 3.0) putem Commons Wikimedia