Razlika između SDS PAGE i gel elektroforeze

SDS PAGE vs Gel Electrophoresis

Elektroforeza se može koristiti za utvrđivanje mase objekta obično za protein i deoksiribonukleinsku kiselinu (DNA). Konac DNA, kada se uvodi u kemikalije, može ubrzati ili usporiti proces informacija. DNK markeri poznate mase koriste se za približavanje veličine objekata koji putuju nakon završetka elektroforeze. Elektroforeza je najvjerojatnije najčešće korišteno sredstvo molekularnih biologa i biokemičara.

Postoje dvije vrste elektroforeze koje se obično koriste u ovom procesu. To su natrijeva dodecil sulfatna poliakrilamidna elektroforeza gela (SDS-PAGE) i elektroforeza nativnog gela.

SDS-PAGE je neselektivna metoda elektroforeze gela koja se koristi u područjima kao što su: biokemija, forenzika, biologija i genetika za odvajanje proteina od njihove elektroforetske pokretljivosti. SDS je anionsko površinski aktivno sredstvo koje se može koristiti za pomoć u liziranju stanica tijekom ekstrakcije DNK i za odvajanje proteina u SDS-PAGE. Tijekom elektroforeze, smjesa proteina se najprije ukapljuje u otopini SDS-a. Tada se tvar zvana Merkaptoeetanol nanosi za uklanjanje disulfidnih veza kako bi protein bio linearan. Tada se započinje elektroforeza. Rezultati bi dali dva ostatka molekula, od kojih je jedna SDS-PAGE.

Odsustvo SDS-PAGE nije problem s obzirom da se elektroforeza gela i dalje može učiniti samo da proteini ne izgube svu svoju sekundarnu i tercijarnu strukturu i ne otvore se u obično ravne šipke.

U međuvremenu, nativni gel elektroforezom koristi gel kao antikonvektivni medij. Obično se koristi za odvajanje bioloških makromolekula poput DNK, ribonukleinske kiseline (RNA) i proteina. Može se koristiti i za odvajanje nanočestica.

Postoje dva glavna gela koja se koriste u prirodnoj gel elektroforezi, naime:

Agarozni gel koji se koristi za veće molekule. Ovaj gel ne utvrđuje male razlike između dvije molekularne vrpce. Također se koristi isključivo za odvajanje DNK. Vizualizacija gela agaroze vrši se mješavinom etidijum bromida.

Poliakrilamidni gel koji se koristi za manje molekule. Ovaj gel utvrđuje razlike između molekularnih vrpci. Osim DNA, može odvojiti i bjelančevine.

Sažetak:

1.SDS-PAGE je neselektivna metoda elektroforeze gela koja se koristi u područjima kao što su: biokemija, forenzika, biologija i genetika za odvajanje proteina od njihove elektroforetske mobilnosti, dok se elektroforeza gela obično koristi za odvajanje bioloških makromolekula poput DNK, ribonukleinska kiselina (RNA) i protein. Može se koristiti i za odvajanje nanočestica.

2.Native gel elektroforeza ima dvije vrste, i to: agarozni gel i poliakrilamidni gel.