Razlika između aktivnog web mjesta i vezivnog web mjesta

ključna razlika između aktivnog web mjesta i obvezujućeg web mjesta je to aktivno mjesto pomaže katalizu kemijskih reakcija dok mjesto vezanja pomaže vezanje liganda na veliku molekulu.

Mjesto vezanja je regija na protein, DNA ili RNA, na koju se ligand može vezati. Enzimi su proteini. Aktivno mjesto je područje enzima na koje se supstrati mogu vezati kako bi prošli kemijsku reakciju. Ovo specifično područje također ima mjesto vezanja zajedno s katalitičkim mjestom. Prema tome, mjesta vezanja pomažu samo u vezivanju liganda na veliku molekulu dok aktivna mjesta pomažu i vezanje liganda na veliku molekulu, dopuštajući mu da prođe kroz kataliziranu kemijsku reakciju.

SADRŽAJ

1. Pregled i ključne razlike
2. Što je aktivno web mjesto
3. Što je mjesto vezanja
4. Usporedna usporedba - Aktivno web mjesto protiv Veževno mjesto u tabelarnom obliku
5. Sažetak

Što je aktivno web mjesto?

Aktivno mjesto je područje enzima na koje se supstrati kemijske reakcije vežu kako bi prošli kataliziranu kemijsku reakciju. ovo se područje sastoji od dvije podregije kao mjesto vezanja i katalitičkog mjesta. Mjesto vezivanja sadrži neke ostatke koji mogu pomoći vezivanju supstrata (reaktanata) na enzim. Katalitičko mjesto pomaže u kataliziranju kemijske reakcije. Nadalje, ovo područje je vrlo malo u usporedbi s čitavim volumenom enzima; otprilike 10-20% cjelokupnog volumena enzima.

Slika 01: Mjesto vezanja i katalitičko mjesto aktivnog web mjesta

Obično aktivno mjesto sadrži 3-4 aminokiseline. ostatak aminokiselina u enzimu koji sudjeluju u održavanju tercijarne strukture enzima. Još važnije, aktivno mjesto ima specifičan dizajn koji se može uklopiti s određenom podlogom. Stoga ti enzimi reagiraju samo s određenim supstratima. Ali ponekad enzimima trebaju kofaktori za svoju funkciju. Glavna funkcija aktivnog mjesta je smanjenje energije aktivacije kemijske reakcije, čime se povećava brzina reakcije.

Što je mjesto vezanja?

Mjesto vezivanja je regija na proteinu, DNK ili RNA na koju se ligandi mogu vezati. Tamo ligand može tvoriti kemijsku vezu s ovim mjestom. Te regije pokazuju specifičnost; određeni ligand vezat će se za određeno vezivno mjesto. Stoga je ovo mjesto mjera vrste liganda koje se mogu vezati s molekulom.

Nadalje, ove regije često koristimo za funkcionalnu karakterizaciju biomolekula. Na primjer, možemo karakterizirati funkcionalnost aktivnog web mjesta putem njegovog obvezujućeg mjesta. Uz to, u slučaju DNK, specifična vrsta mjesta vezanja je mjesto vezivanja transkripcijskog faktora prisutno na DNK.

Koja je razlika između aktivnog web mjesta i mjesta vezanja?

Aktivno mjesto je regija na enzimu za koju se supstrati kemijske reakcije vežu kako bi prošli kataliziranu kemijsku reakciju, dok je mjesto vezivanja područje na protein, DNK ili RNA, na koje se ligandi mogu vezati. Ovo je ključna razlika između aktivnog i vezivnog mjesta. Nadalje, aktivna mjesta prisutna su na enzimima, a oni pomažu povećati brzinu reakcije određene kemijske reakcije smanjenjem aktivacijske barijere energije te reakcije. S druge strane, mjesta vezivanja odgovorna su za vezanje određenog liganda s određenom molekulom.

Podaci u nastavku prikazuju razliku između aktivnog i vezivnog mjesta u tabelarnom obliku.

Sažetak - Aktivno web mjesto vs Vežeće web mjesto

Aktivna mjesta su regije na enzimima koja mogu povećati brzinu reakcije kemijske reakcije smanjenjem aktivacijske barijere energije te reakcije. Vezivno mjesto je svaka regija na koju se ligand može vezati. Aktivno web mjesto također sadrži obvezujuće mjesto. Razlika između aktivnog web mjesta i obvezujućeg web mjesta leži na postojanju i funkcionalnosti. Prema tome, ključna razlika između aktivnog i vezujućeg mjesta je u tome što aktivno mjesto pomaže katalizu kemijske reakcije dok vezivno mjesto pomaže vezanju liganda na veliku molekulu.

Referenca:

1. "Aktivno web mjesto." Wikipedia, Zaklada Wikimedia, 24. srpnja 2018. Dostupno ovdje 
2. "Vezno mjesto." Wikipedia, Zaklada Wikimedia, 28. kolovoza 2018. Dostupno ovdje 

Ljubaznošću slike:

1. "Struktura enzima" Thomas Shafee - Vlastito djelo, (CC BY 4.0) putem Commons Wikimedia