Pljeskavica je važna tehnika za otkrivanje specifičnih sekvenci DNA, RNA i proteina iz njihovih smjesa u molekularnoj biologiji. Izvodi se pomoću membrane koja se zove blot. Postoje različite tehnike brisanja poput sjevernog, južnog i zapadnog upijanja. Odabir odgovarajuće membrane za proces mrljanja treba pažljivo izvršiti kako bi se spriječilo nespecifično vezanje i pogrešna otkrivanja. Nitroceluloza, najlon i PVDF često se koriste membrane u tehnikama brisanja. Imaju različite karakteristike. Ključna razlika između nitroceluloze i najlonske membrane je u tome membrane nitroceluloze imaju visok potencijal imobilizacije proteina dok najlonske membrane imaju visok potencijal imobilizacije nukleinskih kiselina. Međutim, obje se vrste membrane često koriste u tehnikama brisanja.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključne razlike
2. Što je nitrocelulozna membrana
3. Što je najlonska membrana
4. Usporedna usporedba - nitroceluloza i najlonska membrana
5. Sažetak
Nitrocelulozna membrana je često korišteni membranski filter u tehnici nukleinske kiseline i mrlja. Ima visok potencijal vezanja proteina. Stoga se nitrocelulozne membrane široko koriste u tehnici zapadnog upijanja. Nitrocelulozne membrane kompatibilne su sa svim tehnikama hibridizacije i pokazuju superiorne sposobnosti vezanja bez smetnji. Membrane nitroceluloze prirodno su hidrofilne prirode. Ostvaruju hidrofilnu interakciju s molekulama i učinkovito ih imobiliziraju na membranu. Komercijalne nitrocelulozne membrane dostupne su u dvije veličine pora: 0,45 i 0,2 um.
Slika 01: Nitrocelulozna membrana koja se koristi kod Western blot-a
Najlonska membrana je druga vrsta komercijalne membrane koja se koristi u tehnikama brisanja. Alternativno se koristi s nitroceluloznim membranama za južno i sjeverno podmazivanje. Najlonske membrane idealne su za južnu mrlju od nitroceluloze zbog visokog afiniteta vezanja s DNK. Zbog nekoliko jedinstvenih karakteristika najlonskih membrana, istraživači najčešće koriste najlonske membrane za južno i sjeverno mrlju umjesto preko nitrocelulozne membrane. Najlonske membrane se također preporučuju za skidanje i ponovno uklanjanje, za razliku od nitroceluloze.
Slika 02: Najlonska membrana koja se koristi za južno upijanje
Nitroceluloza i najlonska membrana | |
Membrane nitroceluloze krhke su. | Najlonske membrane su manje lomljive. |
Rukovanje | |
Teško su podnijeti. | Jednostavni su za rukovanje. |
Reprobing | |
Nepodržane nitrocelulozne membrane teško je poništiti. | Smetanje je jednostavno s najlonskim membranama. |
Kompatibilnost s raznim uvjetima skladištenja | |
Nitrocelulozne membrane imaju manju čvrstoću da podnose razne uvjete skladištenja. | Najlonske membrane djeluju snažnije na različite uvjete skladištenja. |
Koristiti | |
Potrebno je prethodno vlaženje. | Za najlonske membrane nije potrebno prethodno ocjeđivanje. |
Hidrofilna priroda | |
Nitrocelulozne membrane su hidrofilne prirode, ali su manje hidrofilne od najlonskih membrana. | Oni su izrazito hidrofilne prirode. |
Potencijal imobilizacije | |
Membrane nitroceluloze imaju manji afinitet prema nukleinskim kiselinama. Ali ima visoki afinitet prema proteinima. | Najlonske membrane imaju visok potencijal vezanja s nukleinskim kiselinama od nitroceluloznih membrana. |
Nitrocelulozne i najlonske membrane su posebni listovi koji se koriste u tehnici brisanja kako bi se reproducirao uzorak na gelu. Omogućuju mogućnost otkrivanja određenog niza ili proteina iz smjese imobiliziranjem na membrani. Kad se molekule imobiliziraju na membrani, mogu se koristiti kao supstrat za analizu hibridizacije s obilježenim sondama. Nitrocelulozna membrana se obično koristi za otkrivanje proteina u zapadnoj blot-tehnici zbog visokog afiniteta vezanja s proteinima. Najlon membrane se često koriste za južno i sjeverno mrlje. To je razlika između nitroceluloze i najlonske membrane.
Reference:
1. Hayes, P. C., C. R. Wolf i J. D. Hayes. "Metode brisanja za proučavanje DNK, RNA i proteina." BMJ: British Medical Journal. Američka nacionalna medicinska knjižnica, 14. listopada 1989. Web. 07. april 2017
2. Mahmood, Tahrin i Ping-Chang Yang. "Western Blot: tehnika, teorija i snimanje problema." Sjevernoamerički časopis medicinskih znanosti. Medknow Publikacije & Media Pvt Ltd, rujan 2012. Web. 07. april 2017
Ljubaznošću slike:
1. "Western blot transfer" autor Bensaccount-a na engleskoj Wikipediji (CC BY 3.0) putem Commons Wikimedia