Razlika između Transposona i Retrotransposona

Transposon vs Retrotransposon

Transpozoni i retrotranspozoni su genetske komponente DNK, a među njima postoje velike razlike. Postotna prisutnost ovih genetskih materijala razlikuje se među vrstama, a njihove funkcije određuju sudbine organizma mutacijama i drugim fenotipično važnim promjenama. Transposoni i retrotranspozoni su geni ili zbirke određenih gena smještenih u lancima DNK, a promjene njihovih lokacija bili su glavni uzroci tih posljedica. Međutim, ovaj članak želi ukratko raspraviti funkcije ovih gena i daje usporedbu transpozona i retrotransposozona.

Što je Transposon?

Transpozoni su zanimljivi fragmenti ili segmenti DNK s mogućnošću promjene lokacije lanca DNA u obliku mehanizma za rezanje i lijepljenje. Zbog ove pokretne prirode transpozona, oni su poznati kao skočni geni. Transposoni su dvije glavne vrste poznate kao Transposons klase I i Transposoni klase II. Obično se vrsta klase II naziva transpozonima, a vrsta klase I naziva retrotransposonsima. Procesi rezanja i lijepljenja pokretnih segmenata DNA regulirani su enzimom transpozazom. Enzim se veže na oba kraja transpozona i presiječe fosfodiesterske veze DNA lanaca, izolira transposon, premješta ga na ciljno mjesto i veže se na novom mjestu. Međutim, ovaj je postupak zanimljiv za razumijevanje, jer se neki transpozoni mogu premjestiti na određena mjesta samo zbog nekompatibilnosti baznih nizova s ​​ciljanim mjestom. Geni s jednim krajem jednog lanca imaju istu baznu sekvencu, a drugi kraj drugog pojedinačnog lanca su transpozoni s ljepljivim rubovima, jer se oni mogu vezati za mjesta ciljne DNA niti s istim slijedom baza kao i na ljepljivim krajevima , Međutim, ova pokretljivost gena može uzrokovati promjene genotipa, kao i u fenotipu organizma. Znanstvenici koji su izmislili o transpozonima i genetski modificiranoj hrani i organizmima u skladu s preferiranim prilagođenjima tada su bili dostupni. Visoko produktivni poljoprivredni usjevi, antibiotici sa ljekovitim svojstvima, stoke su neki od pogodno razvijenih proizvoda nakon izuma transpona Barbara McClintock 1940-ih.

Što je Retrotransposon?

Retrotransposoni su transpozoni I klase, a oni se kreću kroz genom mehanizmom kopiranja i lijepljenja. Mehanizam mobilnosti retrotranspozona uključuje nekoliko glavnih koraka, kao što su kopiranje genskog segmenta DNA lanaca u RNA, prijenos kopije RNA na ciljno mjesto, transkripcija RNA sekvence natrag u DNK uz pomoć reverzne transkriptaze i umetanje gena na novo mjesto DNA lana genoma. Dva kraja ovih retrotranspozona obično imaju dugačka krajnja ponavljanja s oko 1000 parova baza, a oni se koriste kao identifikacijska obilježja ovih gena. Ti se geni lako amplificiraju unutar genoma, a postotak retrotranspozona u ljudskom genomu je oko 50%. One bi mogle biti prilično opasne jer uzročnik virusa AIDS-a, HIV-a i T-stanične leukemije ima retrotransposozone u svojim genima RNA. U stvari, ti virusi mogu vezati retrotransposone na bilo kojem mjestu humanih DNA lanaca uz uporabu reverzne transkriptaze i integraze. Enzim integraze djeluje na isti način kao i transpozaza u transpozonima klase II.